More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4222 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0863  membrane protein  82.84 
 
 		 445 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0604  membrane protein  82.84 
 
 		 445 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1274  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  92.99 
 
 		 442 aa  784    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  92.73 
 
 		 442 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2336  membrane protein  82.84 
 
 		 445 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1830  major facilitator family transporter  82.84 
 
 		 445 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  869    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  92.76 
 
 		 442 aa  782    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  97.06 
 
 		 442 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1035  major facilitator family transporter  82.84 
 
 		 445 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  92.76 
 
 		 442 aa  782    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1121  major facilitator family transporter  84.1 
 
 		 445 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2830  major facilitator family transporter  67.82 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2859  major facilitator transporter  67.82 
 
 		 433 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  60.61 
 
 		 456 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  64.72 
 
 		 444 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2952  major facilitator transporter  65.51 
 
 		 433 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  45.52 
 
 		 445 aa  341  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  48.1 
 
 		 439 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 428 aa  317  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 		 442 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  42.35 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.28 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  41.97 
 
 		 447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 434 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 434 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 434 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 442 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  42.62 
 
 		 435 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 454 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 464 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  44.33 
 
 		 434 aa  302  8.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0978  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  43.92 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  45.23 
 
 		 441 aa  299  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 444 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 444 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  39.08 
 
 		 442 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  40.28 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 448 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 448 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 448 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 448 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 445 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  41 
 
 		 436 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 440 aa  296  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 436 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 436 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 442 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 439 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  40.54 
 
 		 433 aa  292  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.21 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  41.73 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4601  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4289  major facilitator superfamily transporter  40.1 
 
 		 437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4223  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 462 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5537  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 450 aa  289  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  41.2 
 
 		 432 aa  289  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  42.48 
 
 		 440 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 443 aa  289  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 449 aa  289  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 433 aa  288  9e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  41.8 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  42.24 
 
 		 440 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1091  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 455 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.768657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 435 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  38.18 
 
 		 451 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 433 aa  286  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  37.94 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  37.94 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>