More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0978 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0978  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 447 aa  883    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5537  major facilitator transporter  67.46 
 
 		 450 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4601  major facilitator transporter  55.4 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4289  major facilitator superfamily transporter  55.63 
 
 		 437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4223  major facilitator transporter  55.63 
 
 		 437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  42 
 
 		 456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2830  major facilitator family transporter  43.75 
 
 		 450 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2859  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 433 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2952  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 433 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 442 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 442 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2336  membrane protein  42.72 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1035  major facilitator family transporter  42.72 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0604  membrane protein  42.72 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1274  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1830  major facilitator family transporter  42.72 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0863  membrane protein  42.72 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1121  major facilitator family transporter  42.51 
 
 		 445 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  38 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 		 439 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  38.57 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  38.63 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  38.24 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 434 aa  257  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 434 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 434 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 434 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 437 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 428 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6975  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 443 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  33.02 
 
 		 432 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  39.1 
 
 		 434 aa  253  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 445 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 437 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 450 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 434 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 		 440 aa  249  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  36.34 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  38 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 466 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 436 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  39.44 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  37.93 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  38.71 
 
 		 435 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.57 
 
 		 439 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 439 aa  243  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5345  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 		 441 aa  243  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12669  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 444 aa  243  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 435 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 442 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  38.94 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  38.94 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  39.2 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  38.94 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  38.94 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  38.97 
 
 		 435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 437 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 435 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 435 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 442 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 446 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  36.73 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>