More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1701 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  100 
 
 		 456 aa  912    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2830  major facilitator family transporter  65.65 
 
 		 450 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  66.9 
 
 		 444 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2859  major facilitator transporter  65.19 
 
 		 433 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  59.54 
 
 		 442 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  59.54 
 
 		 442 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  59.77 
 
 		 442 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2952  major facilitator transporter  65.76 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  60.61 
 
 		 442 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  60.99 
 
 		 442 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  60.61 
 
 		 442 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1121  major facilitator family transporter  59.09 
 
 		 445 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0604  membrane protein  59.23 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1274  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2336  membrane protein  59.23 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0863  membrane protein  59.23 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1035  major facilitator family transporter  59.23 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1830  major facilitator family transporter  59.23 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  45.05 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 450 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 445 aa  309  6.999999999999999e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0978  major facilitator superfamily MFS_1  42 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  41.13 
 
 		 455 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 450 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5537  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 450 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  41.46 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 448 aa  292  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 		 443 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  39.03 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  39.03 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  39.03 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  39.03 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  39.76 
 
 		 440 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 462 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 428 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  39.27 
 
 		 432 aa  282  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 433 aa  282  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  39.52 
 
 		 440 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4601  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 437 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  40.05 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4289  major facilitator superfamily transporter  40.91 
 
 		 437 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4223  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 437 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  40.34 
 
 		 432 aa  280  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.08 
 
 		 442 aa  280  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  38 
 
 		 437 aa  279  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  35.85 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 443 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 439 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 		 442 aa  276  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 437 aa  276  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 437 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 435 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  39.45 
 
 		 441 aa  272  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 448 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.84 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 435 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 455 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  38.21 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 433 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  38.93 
 
 		 432 aa  266  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 441 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  38.97 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  38 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 442 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  41.55 
 
 		 467 aa  264  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 443 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 434 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  35.71 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  35.97 
 
 		 433 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 441 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 441 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 433 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>