More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4914 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  100 
 
 
441 aa  864    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  67.69 
 
 
433 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  62.03 
 
 
435 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  54.12 
 
 
430 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  54.52 
 
 
444 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  54.13 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  50.38 
 
 
424 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  54.26 
 
 
444 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  48.05 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  48.19 
 
 
432 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  46.59 
 
 
433 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  44.32 
 
 
437 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  48.01 
 
 
443 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  47.47 
 
 
432 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  47.18 
 
 
441 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.35 
 
 
437 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  46.28 
 
 
440 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  48.69 
 
 
428 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  46.86 
 
 
441 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  47.57 
 
 
444 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  46.54 
 
 
441 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  45.81 
 
 
445 aa  358  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  46.51 
 
 
442 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  46.3 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  45.22 
 
 
436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 
444 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  46.3 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  46.06 
 
 
441 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  46.27 
 
 
433 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  45.82 
 
 
441 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  45.82 
 
 
441 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  47 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  46.62 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  46.62 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  46.62 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  46.62 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  46.62 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.83 
 
 
443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  47.21 
 
 
441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.66 
 
 
440 aa  352  7e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  44.31 
 
 
440 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  45.27 
 
 
437 aa  352  8e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 
444 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  46.53 
 
 
469 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  45.43 
 
 
443 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.19 
 
 
439 aa  349  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  46.08 
 
 
432 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  43.12 
 
 
442 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  43.43 
 
 
444 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  46.99 
 
 
432 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  42.68 
 
 
445 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  48.05 
 
 
445 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 
440 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  42.36 
 
 
454 aa  346  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  44.98 
 
 
434 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 
449 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  46.42 
 
 
439 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  43.86 
 
 
432 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  45.43 
 
 
434 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  42.33 
 
 
442 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  44.26 
 
 
433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  44.26 
 
 
433 aa  340  4e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  45.2 
 
 
434 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  52 
 
 
433 aa  339  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  43.41 
 
 
437 aa  339  7e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  42.55 
 
 
452 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  46.52 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  46.52 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  46.52 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  47.49 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.52 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.52 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.52 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  42.86 
 
 
448 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  42.86 
 
 
448 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  42.86 
 
 
448 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 
439 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  44.8 
 
 
435 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.78 
 
 
439 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  43.69 
 
 
442 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 
430 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  44.08 
 
 
437 aa  333  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  42.76 
 
 
434 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  40.98 
 
 
441 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  42.49 
 
 
462 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 
440 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
445 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  41.37 
 
 
449 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
445 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 
450 aa  329  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  43.98 
 
 
441 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  41.63 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  41.86 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  42.86 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  46.96 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  43.1 
 
 
440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  41.72 
 
 
459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  41.06 
 
 
455 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>