More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2120 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  100 
 
 
435 aa  847    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  62.32 
 
 
439 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  60.28 
 
 
439 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  51.31 
 
 
432 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  48.91 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  53.73 
 
 
444 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  53.61 
 
 
430 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  50.59 
 
 
432 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  48.43 
 
 
442 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  47.97 
 
 
432 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  52.7 
 
 
444 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  49.52 
 
 
428 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  49.53 
 
 
450 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  50 
 
 
440 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  50.48 
 
 
435 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  47.7 
 
 
433 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  52.76 
 
 
443 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  49.75 
 
 
443 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  48.82 
 
 
445 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  48.57 
 
 
437 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  46.75 
 
 
462 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  48.21 
 
 
432 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  47.34 
 
 
441 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  48.59 
 
 
436 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 
430 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  46.85 
 
 
459 aa  359  5e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  48.75 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  48.21 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 
441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 
441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  50.25 
 
 
433 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  46.67 
 
 
444 aa  352  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  45.99 
 
 
441 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  45.99 
 
 
441 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 
424 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  44.89 
 
 
440 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  43.83 
 
 
445 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  44.89 
 
 
440 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  44.89 
 
 
440 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  45.85 
 
 
441 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  45.85 
 
 
441 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  44.44 
 
 
442 aa  345  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  43.93 
 
 
442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 
439 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  45.41 
 
 
440 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  45.37 
 
 
441 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.93 
 
 
437 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  44.53 
 
 
441 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  43.78 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  44.02 
 
 
440 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.24 
 
 
439 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  48.28 
 
 
434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  48.28 
 
 
434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  48.28 
 
 
434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  42.21 
 
 
437 aa  338  8e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 
444 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  45.5 
 
 
442 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  42.68 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  46.34 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  44.58 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  45.11 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  44.53 
 
 
454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  45.54 
 
 
436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 
444 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  44.01 
 
 
449 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  47.55 
 
 
434 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  45.63 
 
 
434 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  42.44 
 
 
437 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  44.79 
 
 
436 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  46.06 
 
 
436 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 
440 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  44.44 
 
 
441 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  42.65 
 
 
440 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  46.28 
 
 
436 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  46.06 
 
 
436 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  46.06 
 
 
436 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  46.06 
 
 
436 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  44.47 
 
 
441 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  44.61 
 
 
441 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  44.61 
 
 
441 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  45.82 
 
 
436 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  44.61 
 
 
441 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  46.89 
 
 
431 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  43.64 
 
 
439 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  44.12 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  42.17 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  46.65 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  44.12 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  46.93 
 
 
441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 
444 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  44.74 
 
 
435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  42.48 
 
 
437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  46.93 
 
 
441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  41.06 
 
 
436 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  45.35 
 
 
440 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  48.04 
 
 
434 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  44.5 
 
 
435 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  44.5 
 
 
435 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  43.28 
 
 
437 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  44.94 
 
 
441 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>