More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5441 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  92.66 
 
 		 436 aa  721    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  94.02 
 
 		 436 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  86.21 
 
 		 436 aa  668    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  94.02 
 
 		 436 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  864    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  94.02 
 
 		 436 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  97.48 
 
 		 436 aa  749    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  77.98 
 
 		 436 aa  626  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  76.47 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  76.24 
 
 		 431 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  60.92 
 
 		 432 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  63.21 
 
 		 432 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  59.08 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  60.19 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  60.28 
 
 		 432 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  62.41 
 
 		 437 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  53.38 
 
 		 430 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  53.63 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  53.13 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  50.34 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  51.99 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  51.89 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  51.3 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  49.41 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  48.75 
 
 		 450 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  48.59 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  50.86 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  48.71 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  52.23 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  48.5 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  48.59 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  47.66 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  45.62 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  48.6 
 
 		 440 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  49.06 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  47.21 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  49.03 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  46.83 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 444 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 439 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  47.6 
 
 		 441 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 435 aa  362  9e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  46.41 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  47.36 
 
 		 469 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  47.12 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  47.12 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  47.12 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.12 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  47.12 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 454 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 441 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 454 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  47.36 
 
 		 441 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 436 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 436 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  47.39 
 
 		 435 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 439 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  46.39 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 435 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 435 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  46.74 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  47.74 
 
 		 434 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  48.1 
 
 		 436 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  43.51 
 
 		 451 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 440 aa  352  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  47.52 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  42.52 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 		 439 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  45.05 
 
 		 434 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  46.65 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  47.52 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  47.34 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.74 
 
 		 439 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  46.32 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>