More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5038 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
431 aa  842    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  95.82 
 
 
431 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  78.67 
 
 
436 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  75.87 
 
 
436 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  76.94 
 
 
436 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  76.11 
 
 
436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  76.11 
 
 
436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  76.47 
 
 
436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  76.11 
 
 
436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  71.23 
 
 
436 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  64.37 
 
 
432 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  61.54 
 
 
432 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  63.57 
 
 
432 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  59.86 
 
 
432 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  59.95 
 
 
433 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  66 
 
 
437 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  52.88 
 
 
430 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  50.7 
 
 
432 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  52.38 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  52.13 
 
 
444 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  51.81 
 
 
441 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  51.2 
 
 
437 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  50 
 
 
439 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
444 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  50.23 
 
 
439 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  46.24 
 
 
442 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
450 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  47.11 
 
 
443 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  48.13 
 
 
428 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  51.08 
 
 
436 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  51.39 
 
 
441 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 
441 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  50.12 
 
 
445 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  51.71 
 
 
443 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 
441 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  46.59 
 
 
440 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  48.2 
 
 
440 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  47.37 
 
 
435 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  46.55 
 
 
433 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  50.12 
 
 
440 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  49.42 
 
 
435 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  45.75 
 
 
437 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  45.58 
 
 
454 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  45.26 
 
 
440 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  43.69 
 
 
436 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  45.12 
 
 
440 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  45.5 
 
 
440 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  45.12 
 
 
440 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  48.48 
 
 
434 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  48.1 
 
 
434 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  47.93 
 
 
441 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  48.35 
 
 
435 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  48.42 
 
 
441 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  48.42 
 
 
441 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  46.1 
 
 
424 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  48.42 
 
 
441 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  48.16 
 
 
469 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  48.16 
 
 
440 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  48.16 
 
 
440 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  48.16 
 
 
440 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  48.16 
 
 
440 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  48.16 
 
 
440 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  46.72 
 
 
443 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  48.93 
 
 
442 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  47.55 
 
 
441 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  43.97 
 
 
440 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  45.97 
 
 
459 aa  363  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  45.5 
 
 
462 aa  362  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  48.48 
 
 
434 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  47.45 
 
 
441 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  47.67 
 
 
439 aa  362  8e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  47.45 
 
 
441 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  47.65 
 
 
444 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  48.29 
 
 
445 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  44.29 
 
 
451 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  45.91 
 
 
454 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  47.55 
 
 
469 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  45.61 
 
 
433 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  44.55 
 
 
452 aa  359  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  48.23 
 
 
444 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  44.18 
 
 
437 aa  359  6e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  46.41 
 
 
434 aa  358  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  46.17 
 
 
439 aa  358  9e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  47.87 
 
 
459 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  49.53 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  47.04 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  47.88 
 
 
444 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  46.93 
 
 
434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  46.93 
 
 
434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  46.93 
 
 
434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  43.51 
 
 
437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  49.53 
 
 
441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  43.51 
 
 
435 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  48.7 
 
 
434 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  46.67 
 
 
441 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  48.95 
 
 
454 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  45.19 
 
 
445 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  48.45 
 
 
444 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  48.95 
 
 
454 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  46.71 
 
 
439 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>