More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1619 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  95.82 
 
 
431 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  100 
 
 
431 aa  841    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  78.44 
 
 
436 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  75.41 
 
 
436 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  76.24 
 
 
436 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  76.11 
 
 
436 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  76.11 
 
 
436 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  76.24 
 
 
436 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  76.11 
 
 
436 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  71.46 
 
 
436 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  63.18 
 
 
432 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  61.31 
 
 
432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  62.65 
 
 
432 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  59.39 
 
 
432 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  60.65 
 
 
433 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  65.01 
 
 
437 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  51.74 
 
 
430 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  53.23 
 
 
444 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  52.99 
 
 
444 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  51.81 
 
 
441 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  50.96 
 
 
437 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  49.63 
 
 
439 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  46.47 
 
 
442 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
444 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  49.41 
 
 
450 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  46.74 
 
 
443 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  48.38 
 
 
428 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  50.84 
 
 
436 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  51.97 
 
 
443 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  49.54 
 
 
435 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  49.65 
 
 
445 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 
439 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  50.89 
 
 
441 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 
441 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  47.13 
 
 
435 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  46.82 
 
 
440 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  47.96 
 
 
440 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 
441 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  48.22 
 
 
434 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  47.56 
 
 
441 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  45.72 
 
 
436 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  45.48 
 
 
440 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  50.12 
 
 
440 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  48.69 
 
 
434 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  45.07 
 
 
433 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  47.91 
 
 
469 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  44.63 
 
 
454 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  45.52 
 
 
437 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  47.91 
 
 
440 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  47.91 
 
 
440 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  47.54 
 
 
441 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.91 
 
 
440 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  47.91 
 
 
440 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 
424 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  47.8 
 
 
441 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  45.11 
 
 
440 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  47.91 
 
 
440 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  47.32 
 
 
441 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  47.8 
 
 
441 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  47.8 
 
 
441 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  45.11 
 
 
440 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  47.55 
 
 
469 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  47.32 
 
 
441 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  45.11 
 
 
440 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  48.69 
 
 
434 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  47.8 
 
 
445 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  48.82 
 
 
441 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  46.21 
 
 
445 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  49.3 
 
 
441 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  48.22 
 
 
442 aa  359  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  45.5 
 
 
443 aa  358  9e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  43.5 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  44.02 
 
 
451 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  45.68 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  43.76 
 
 
452 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  47.95 
 
 
434 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  47.95 
 
 
434 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  47.95 
 
 
434 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  46.74 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  47.72 
 
 
440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  47.02 
 
 
444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  47.59 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  46.38 
 
 
434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  44.95 
 
 
437 aa  356  5e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  46.95 
 
 
439 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  47.74 
 
 
444 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  44.89 
 
 
433 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  44.08 
 
 
462 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  45.5 
 
 
459 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  48.57 
 
 
434 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  45.75 
 
 
435 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  45.67 
 
 
454 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  47.98 
 
 
444 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  45.75 
 
 
435 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  43.71 
 
 
437 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  45.75 
 
 
435 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  46.43 
 
 
441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  48.33 
 
 
435 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  48.29 
 
 
459 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>