More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2174 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  100 
 
 
433 aa  856    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  52.11 
 
 
453 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  51 
 
 
444 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  49.25 
 
 
443 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  49.75 
 
 
432 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  48.41 
 
 
443 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  48.4 
 
 
432 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  46.38 
 
 
426 aa  368  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  43.68 
 
 
437 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  49.5 
 
 
432 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 
424 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  47.19 
 
 
441 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  44.94 
 
 
433 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  48.15 
 
 
432 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  47.44 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  46.54 
 
 
434 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  46.54 
 
 
434 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  43.42 
 
 
433 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  47.39 
 
 
434 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  47.39 
 
 
434 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  47.39 
 
 
434 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  47.43 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  46.92 
 
 
434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  45.48 
 
 
441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  47.43 
 
 
440 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  47.43 
 
 
440 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.43 
 
 
440 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  47.43 
 
 
440 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  47.43 
 
 
440 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  46.51 
 
 
444 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 
440 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 
430 aa  350  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  46.1 
 
 
441 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  45.61 
 
 
441 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  46.1 
 
 
441 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  44.52 
 
 
441 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  46.1 
 
 
441 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  45.11 
 
 
441 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  43.94 
 
 
442 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  45.99 
 
 
444 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  46.21 
 
 
469 aa  345  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.04 
 
 
437 aa  345  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  46.77 
 
 
434 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  47.47 
 
 
437 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.49 
 
 
439 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  44.42 
 
 
454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  45.02 
 
 
439 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  44.88 
 
 
443 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  46.56 
 
 
437 aa  342  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  45.67 
 
 
440 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  43.58 
 
 
441 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  45.65 
 
 
454 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.21 
 
 
443 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.12 
 
 
440 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.02 
 
 
439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  42.65 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  48.57 
 
 
436 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  48.39 
 
 
432 aa  340  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  45.37 
 
 
436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  43.91 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  46.92 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  49.01 
 
 
436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  45.73 
 
 
445 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  41.67 
 
 
436 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 
444 aa  335  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
441 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  45.23 
 
 
444 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  43.46 
 
 
442 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 
441 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  41.04 
 
 
459 aa  333  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  43.81 
 
 
452 aa  332  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  41.55 
 
 
433 aa  332  7.000000000000001e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  45.19 
 
 
439 aa  332  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  41.55 
 
 
433 aa  332  8e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  43.45 
 
 
436 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  47.74 
 
 
436 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 
444 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  44.9 
 
 
445 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  43.45 
 
 
436 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  46.1 
 
 
435 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  43.45 
 
 
436 aa  330  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  42.29 
 
 
441 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  43.82 
 
 
450 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  44.28 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  43.48 
 
 
451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  46.89 
 
 
436 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  43.11 
 
 
440 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  43.07 
 
 
440 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.93 
 
 
437 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  45.76 
 
 
439 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  43.6 
 
 
428 aa  325  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  45.61 
 
 
435 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  42.86 
 
 
440 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  42.86 
 
 
440 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 
449 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  43.11 
 
 
440 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  43.2 
 
 
437 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  48.28 
 
 
436 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>