More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4805 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  97.01 
 
 		 435 aa  802    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  99.31 
 
 		 435 aa  840    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  97.01 
 
 		 435 aa  802    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  97.01 
 
 		 435 aa  803    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  848    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8308  major facilitator superfamily MFS_1  60.19 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  51.27 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  48.74 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  45.89 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  44.79 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  45.99 
 
 		 433 aa  358  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  49.39 
 
 		 439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  47 
 
 		 440 aa  349  6e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  46.57 
 
 		 432 aa  348  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 		 430 aa  345  7e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  44.93 
 
 		 432 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  43.96 
 
 		 432 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  46.75 
 
 		 428 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 459 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  47.27 
 
 		 444 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 437 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 		 450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  47.01 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  45.91 
 
 		 445 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 454 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 454 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 		 424 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.89 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  48.22 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  48.22 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  48.22 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  47.51 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  46.43 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  46.43 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  46.43 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  47.74 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 439 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 436 aa  325  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 436 aa  325  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 459 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 459 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  47.51 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  47.74 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 474 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  43.8 
 
 		 444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 441 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 441 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 437 aa  318  9e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  46.25 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 439 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  46.62 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  41.38 
 
 		 453 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 462 aa  312  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 440 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  41.84 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  44.76 
 
 		 431 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 442 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.83 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  41 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  43.91 
 
 		 436 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 452 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 		 449 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  41.63 
 
 		 469 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.63 
 
 		 440 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.63 
 
 		 440 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>