More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5387 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  884    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  52.15 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3497  major facilitator transporter  52.78 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.61978  hitchhiker  0.00838162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  52.78 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  52.33 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7147  major facilitator superfamily MFS_1  53.35 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.604995 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  52.98 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2524  major facilitator transporter  52.3 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3929  major facilitator transporter  52.78 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  52.47 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  51.44 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5738  major facilitator superfamily MFS_1  51.07 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3591  major facilitator transporter  52.3 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  53.46 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  51.97 
 
 		 445 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  51.19 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1097  major facilitator family transporter  54.17 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0387869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  51.79 
 
 		 448 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0348  major facilitator family transporter  53.68 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1799  major facilitator family transporter  53.68 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1389  major facilitator family transporter  53.27 
 
 		 751 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0215  major facilitator family transporter  53.27 
 
 		 751 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25421  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0950  major facilitator family transporter  53.27 
 
 		 751 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.601633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1884  major facilitator family transporter  52.58 
 
 		 431 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530062  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0430  major facilitator family transporter  53.27 
 
 		 797 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5189  major facilitator transporter  51.04 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.593783  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  42.89 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 440 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  40.05 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 428 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  42.46 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 448 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 448 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 448 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  42.48 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  39.31 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  39.44 
 
 		 432 aa  297  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  42.48 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 441 aa  296  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 443 aa  295  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  42.61 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 441 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 441 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  40.63 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 439 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  42.38 
 
 		 442 aa  288  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  42.76 
 
 		 444 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.55 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  40.55 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  40.55 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  40.55 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  40.55 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  40.55 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 450 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 430 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  38.64 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 434 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 434 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 434 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  42.38 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 434 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  37.44 
 
 		 455 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 450 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  40.3 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  40.25 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  41.23 
 
 		 433 aa  283  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  38.39 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>