More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3079 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  100 
 
 		 457 aa  896    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  71.62 
 
 		 449 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  70.45 
 
 		 452 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  70.91 
 
 		 452 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  71.73 
 
 		 458 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  55.97 
 
 		 435 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  55.19 
 
 		 435 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  55.42 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  55.19 
 
 		 440 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  54.35 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 443 aa  355  8.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 441 aa  352  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  44.89 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  47.7 
 
 		 445 aa  343  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 462 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42.68 
 
 		 432 aa  338  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  42.72 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  44.01 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  42.76 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  41.59 
 
 		 432 aa  330  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  40.8 
 
 		 432 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  44.02 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 441 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  41.65 
 
 		 433 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.25 
 
 		 440 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 		 441 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 440 aa  319  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 441 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 441 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 441 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 435 aa  316  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  40 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 		 430 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 		 424 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.73 
 
 		 469 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 439 aa  312  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 		 432 aa  312  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  40.83 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  40.83 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  40.83 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  40.83 
 
 		 469 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  40.83 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  40.83 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 433 aa  309  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  42.33 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  43.98 
 
 		 430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 448 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 		 444 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 434 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.95 
 
 		 439 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 434 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 434 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 434 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  40.41 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  40.83 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  42 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 444 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 433 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 454 aa  302  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 434 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 452 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 450 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  41.34 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 444 aa  300  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  42.38 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  42.43 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 445 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 440 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 444 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>