More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1316 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  100 
 
 		 443 aa  879    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5023  major facilitator transporter  79.78 
 
 		 443 aa  691    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  71.26 
 
 		 447 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25970  Major facilitator superfamily protein  75.18 
 
 		 414 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6975  major facilitator superfamily MFS_1  70.8 
 
 		 443 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  65.91 
 
 		 440 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3869  major facilitator transporter  67.67 
 
 		 442 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0325086  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5091  major facilitator transporter  65.91 
 
 		 440 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792856  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1999  major facilitator transporter  51.19 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0211395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  44.06 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2562  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.144453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 436 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 437 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 		 440 aa  352  7e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 441 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  45.28 
 
 		 442 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 441 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 434 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 437 aa  349  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.42 
 
 		 437 aa  349  5e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 454 aa  348  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 434 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  44.31 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 436 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 436 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3391  tartrate MFS transporter, putative  46.48 
 
 		 438 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200595  normal  0.335671 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  44.07 
 
 		 433 aa  346  6e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 445 aa  345  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 439 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 		 439 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  41.83 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  44.63 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.44 
 
 		 439 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 434 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  43.37 
 
 		 469 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  43.37 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  43.37 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  43.37 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  43.37 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.37 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  43.83 
 
 		 440 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 442 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41 
 
 		 441 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 443 aa  332  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 443 aa  332  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 441 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  41.06 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.59 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 440 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 477 aa  328  9e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 443 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 441 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  43.3 
 
 		 455 aa  325  9e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  43.03 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  43.2 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 452 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 462 aa  323  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  44.27 
 
 		 430 aa  323  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  42.29 
 
 		 437 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4780  d-galactonate transporter  40.51 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3214  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 488 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 		 445 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  42.01 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 444 aa  319  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 450 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 442 aa  319  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>