More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3391 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3391  tartrate MFS transporter, putative  100 
 
 		 438 aa  884    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200595  normal  0.335671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2562  major facilitator transporter  92.91 
 
 		 438 aa  798    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.144453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6975  major facilitator superfamily MFS_1  47.28 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5023  major facilitator transporter  46.86 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25970  Major facilitator superfamily protein  50.25 
 
 		 414 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  46.93 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  47.17 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3869  major facilitator transporter  47.89 
 
 		 442 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0325086  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1999  major facilitator transporter  48.83 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0211395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5091  major facilitator transporter  48.05 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792856  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  40.34 
 
 		 451 aa  339  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 436 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 437 aa  335  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 441 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.39 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 441 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 434 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 442 aa  328  9e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  42.48 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  38.46 
 
 		 441 aa  326  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.83 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 462 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 441 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 		 444 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  39.23 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 454 aa  320  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 477 aa  319  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  38.63 
 
 		 469 aa  319  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  38.63 
 
 		 440 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  38.63 
 
 		 440 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  38.63 
 
 		 440 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  38.63 
 
 		 440 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  38.63 
 
 		 440 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 452 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  38.14 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 441 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 442 aa  317  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 435 aa  317  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 441 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 441 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  38.76 
 
 		 433 aa  316  6e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 442 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 452 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  41.5 
 
 		 455 aa  315  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  40.05 
 
 		 440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.72 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 442 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  41.19 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  39.47 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 		 445 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 440 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4220  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 440 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  39.03 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 437 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  42.14 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.9 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  41.9 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.9 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.9 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  38.73 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.9 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>