More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5023 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  79.78 
 
 		 443 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5023  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  880    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  70.27 
 
 		 447 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25970  Major facilitator superfamily protein  73.61 
 
 		 414 aa  618  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6975  major facilitator superfamily MFS_1  70.82 
 
 		 443 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  66.51 
 
 		 440 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3869  major facilitator transporter  64.25 
 
 		 442 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0325086  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5091  major facilitator transporter  65.84 
 
 		 440 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792856  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1999  major facilitator transporter  49.09 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0211395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2562  major facilitator transporter  46.84 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.144453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  44.29 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 436 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 437 aa  359  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  43.4 
 
 		 434 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 434 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 434 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 434 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 436 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 452 aa  350  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 436 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 443 aa  349  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 436 aa  349  6e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 		 444 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.79 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3391  tartrate MFS transporter, putative  46.86 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200595  normal  0.335671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  43.4 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 439 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.17 
 
 		 469 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 437 aa  342  5.999999999999999e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.17 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.17 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.17 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.17 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.17 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 444 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  41.9 
 
 		 433 aa  342  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.44 
 
 		 454 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  41.67 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  40.42 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 442 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  41.4 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  40.62 
 
 		 469 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 442 aa  332  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 443 aa  332  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 440 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  44.9 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  42.39 
 
 		 437 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 443 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 488 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 477 aa  329  7e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  41.44 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  40 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  40 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  40 
 
 		 441 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.56 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  42.56 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  42.79 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.56 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.56 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  42.56 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  41.07 
 
 		 452 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.56 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  41.79 
 
 		 456 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 		 449 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 450 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 444 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 456 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>