More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2646 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 453 aa  897    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2926  major facilitator transporter  67.21 
 
 		 446 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2422  major facilitator superfamily MFS_1  69.18 
 
 		 450 aa  554  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  49.65 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  44.44 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42.96 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  44.03 
 
 		 432 aa  343  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 443 aa  342  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 437 aa  342  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  44.14 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  43.75 
 
 		 433 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 439 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 454 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 435 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 440 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  46.1 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.5 
 
 		 437 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 441 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 434 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  42.79 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  42.58 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  43.41 
 
 		 445 aa  323  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  40.97 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 439 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  40.74 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 452 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.39 
 
 		 439 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 437 aa  318  7.999999999999999e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 434 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  39.95 
 
 		 451 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  42.18 
 
 		 431 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 430 aa  316  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  40.78 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  40.78 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 436 aa  312  6.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 		 432 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 428 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  43.79 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 462 aa  305  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  42.2 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  40.5 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  36.28 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 454 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  35.51 
 
 		 441 aa  298  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  42.11 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  41.88 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>