More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2422 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2926  major facilitator transporter  80.8 
 
 		 446 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2422  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 450 aa  875    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  69.18 
 
 		 453 aa  578  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  51.42 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  51.18 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  51.42 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  46.06 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  43.78 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  45.33 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  44.76 
 
 		 433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  45.14 
 
 		 443 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  44.22 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  43.19 
 
 		 445 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  44.01 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 444 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 437 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 437 aa  322  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 442 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 444 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 434 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  44.66 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  40.46 
 
 		 451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 433 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  41.14 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 		 439 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 454 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.91 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  44.18 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 445 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  41.06 
 
 		 453 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  41.42 
 
 		 440 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  41.09 
 
 		 431 aa  302  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 435 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  39.44 
 
 		 441 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 437 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 452 aa  299  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 435 aa  298  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  42.17 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 426 aa  296  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 462 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  39.03 
 
 		 444 aa  296  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  42.28 
 
 		 442 aa  294  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 441 aa  294  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  38.84 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 		 430 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  43.74 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 469 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 430 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 441 aa  293  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 441 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 441 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  40 
 
 		 469 aa  292  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 442 aa  292  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  40.24 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  40.24 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>