More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0632 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  81 
 
 
458 aa  773    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1171  4-hydroxyphenylacetate permease  79.91 
 
 
458 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1066  4-hydroxyphenylacetate permease  79.91 
 
 
458 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  81.22 
 
 
458 aa  773    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0632  4-hydroxyphenylacetate transporter  100 
 
 
456 aa  919    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.862477  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1202  4-hydroxyphenylacetate permease  79.69 
 
 
458 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1217  4-hydroxyphenylacetate permease  79.91 
 
 
458 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126319  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  81 
 
 
458 aa  773    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  80.79 
 
 
458 aa  770    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.517033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2358  4-hydroxyphenylacetate permease  78.52 
 
 
455 aa  695    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.876442  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1182  4-hydroxyphenylacetate permease  79.69 
 
 
458 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1641  4-hydroxyphenylacetate permease  78.52 
 
 
455 aa  694    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2454  4-hydroxyphenylacetate transporter  78.52 
 
 
455 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.564928  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4191  4-hydroxyphenylacetate transporter  60.41 
 
 
454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  43.36 
 
 
432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  43.91 
 
 
432 aa  346  6e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  42.22 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  42.03 
 
 
432 aa  335  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 
430 aa  332  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.17 
 
 
440 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  43.2 
 
 
432 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  42.33 
 
 
444 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 
444 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  41.77 
 
 
433 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 
432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  40.23 
 
 
434 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  40.23 
 
 
434 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  40.23 
 
 
434 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  40.7 
 
 
434 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  40.7 
 
 
434 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  40.23 
 
 
434 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  41.13 
 
 
455 aa  315  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  38.83 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.69 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  42.89 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  38.43 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  39.19 
 
 
436 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 
440 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  40.5 
 
 
443 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  37.62 
 
 
437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  39.19 
 
 
442 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  40.23 
 
 
434 aa  310  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  38.41 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  39.91 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  39.77 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  41.03 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  38.14 
 
 
443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  38.94 
 
 
454 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  37.84 
 
 
442 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  40.09 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  40.96 
 
 
445 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  39.23 
 
 
443 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  39.67 
 
 
439 aa  306  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  38.84 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 
444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  39.02 
 
 
442 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  39.19 
 
 
442 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 
444 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 
430 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  40.24 
 
 
440 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  36.22 
 
 
441 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 
445 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  37.56 
 
 
443 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  37.27 
 
 
442 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  37.47 
 
 
436 aa  299  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  37.47 
 
 
436 aa  299  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  39.57 
 
 
459 aa  299  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 
440 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  37.25 
 
 
441 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  37.42 
 
 
462 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  37.25 
 
 
441 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  37.22 
 
 
442 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  40.2 
 
 
445 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 
444 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  37.33 
 
 
436 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  37.58 
 
 
440 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  36.97 
 
 
441 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  37.11 
 
 
441 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  37.11 
 
 
441 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  37.59 
 
 
441 aa  295  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  37.88 
 
 
433 aa  294  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  39.04 
 
 
435 aa  294  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  37.3 
 
 
452 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  39.8 
 
 
440 aa  293  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 
441 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 
441 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  37.56 
 
 
433 aa  292  7e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 
452 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  37.18 
 
 
451 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 
444 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  38.2 
 
 
439 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  38.14 
 
 
456 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  38.44 
 
 
444 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  37.3 
 
 
441 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  36.81 
 
 
434 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  36.81 
 
 
441 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  37.83 
 
 
441 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  39.67 
 
 
439 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  41.07 
 
 
436 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>