More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6476 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  863    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  863    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  51.15 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  45.56 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 445 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 443 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.48 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  44.73 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  44.1 
 
 		 444 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 454 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  44.15 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4302  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 449 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392665  normal  0.708279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  42.69 
 
 		 440 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0341  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 453 aa  326  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  41.19 
 
 		 451 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 442 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 439 aa  322  9.000000000000001e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  43.89 
 
 		 459 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 454 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4220  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 443 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4811  d-galactonate transporter  42.92 
 
 		 448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00271172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 442 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 449 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4198  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 459 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0649203  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4780  d-galactonate transporter  43.13 
 
 		 444 aa  315  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  40.49 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  42.08 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  42.08 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 		 440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 443 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  45.57 
 
 		 443 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 435 aa  312  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 441 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 441 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  42.11 
 
 		 444 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  42.57 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.47 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 		 440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  40.59 
 
 		 433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 437 aa  305  9.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  43.6 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  40.34 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 434 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 		 444 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  43.31 
 
 		 435 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1058  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  41.33 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.83 
 
 		 469 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 434 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 434 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 434 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 434 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.09 
 
 		 440 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  41.09 
 
 		 440 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.09 
 
 		 440 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  41.09 
 
 		 440 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  41.09 
 
 		 440 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 435 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  40.62 
 
 		 469 aa  299  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  42.18 
 
 		 432 aa  299  7e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5460  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  40.62 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>