132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1791 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1791  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  842    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0460445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3759  major facilitator transporter  60.2 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0990  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 445 aa  290  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.72949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  25.06 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 441 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.97 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 		 437 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 431 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2851  transporter, putative  31.73 
 
 		 512 aa  50.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  25 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  22.37 
 
 		 400 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  22.83 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  22.83 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  24.18 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.12 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  22.37 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  22.37 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  20.29 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  20.29 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  22.17 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  22.37 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  22.37 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  22.37 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  25.67 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  24.81 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1258  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 513 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  21.83 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1052  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 510 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 452 aa  46.6  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 428 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  22.61 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  22.61 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  21.13 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0820  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2826  major facilitator transporter  30 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  22.61 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2924  major facilitator transporter  30 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  21.67 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  23.62 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  22.61 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  22.61 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  22.61 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  25.61 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  23.51 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  22.61 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1505  transporter, putative  29.09 
 
 		 514 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2875  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 517 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0920  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 512 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.732822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1000  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 510 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  21.26 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  20.39 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>