More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0209 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 452 aa  855    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 489 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 498 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  38.5 
 
 		 495 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 		 464 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  37.85 
 
 		 462 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 		 504 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  37.83 
 
 		 471 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  32.81 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 462 aa  156  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  29.13 
 
 		 468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  32.39 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 474 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 479 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 492 aa  93.2  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 496 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 496 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.73 
 
 		 565 aa  87  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.45 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 531 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  25 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 531 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.45 
 
 		 504 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0727  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.12 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.43 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  26.4 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.85 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.91 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.55 
 
 		 538 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.3 
 
 		 491 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.52 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  25.31 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.31 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4062  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.82 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.35 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.09 
 
 		 539 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 539 aa  79  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  25.31 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  25.31 
 
 		 549 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.34 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  25.31 
 
 		 531 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  25.31 
 
 		 531 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.31 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.17 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.17 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 		 504 aa  76.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.83 
 
 		 541 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 243 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.15 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.46 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  20.83 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4933  transport transmembrane protein  30.69 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.27 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  22.17 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.67 
 
 		 549 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2200  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0335297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2238  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000374432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  22.17 
 
 		 537 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  22.17 
 
 		 537 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  22.17 
 
 		 537 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  22.17 
 
 		 537 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 502 aa  73.2  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.13 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.33 
 
 		 525 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.87 
 
 		 476 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  31.11 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2324  putative transport transmembrane protein  26.2 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  24.94 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 528 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.48 
 
 		 480 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  21.8 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.7 
 
 		 532 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.04 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.88 
 
 		 538 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  22.04 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.25 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>