More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2662 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  68.36 
 
 		 537 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  80.41 
 
 		 531 aa  873    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4552  major facilitator superfamily MFS_1  68.44 
 
 		 530 aa  681    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.93 
 
 		 531 aa  917    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  66.92 
 
 		 532 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.12 
 
 		 549 aa  920    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  100 
 
 		 531 aa  1054    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  95.48 
 
 		 531 aa  988    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.12 
 
 		 549 aa  926    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4062  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  80.23 
 
 		 531 aa  860    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  85.12 
 
 		 531 aa  920    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  68.52 
 
 		 548 aa  695    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  94.35 
 
 		 531 aa  986    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  97.18 
 
 		 531 aa  1011    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.36 
 
 		 508 aa  789    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  98.49 
 
 		 531 aa  1041    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  85.12 
 
 		 531 aa  920    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  97.18 
 
 		 531 aa  1011    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3480  major facilitator superfamily MFS_1  68.44 
 
 		 530 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  84.93 
 
 		 531 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  96.8 
 
 		 531 aa  1009    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  84.93 
 
 		 531 aa  917    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  84.93 
 
 		 549 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7236  major facilitator superfamily MFS_1  52.92 
 
 		 545 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5307  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.72 
 
 		 530 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777594 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4436  major facilitator transporter  53.98 
 
 		 502 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4104  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.16 
 
 		 518 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0540  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  52.58 
 
 		 502 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.380865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1830  major facilitator superfamily drug efflux transporter  52.19 
 
 		 538 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2926  multidrug transporter, putative  50.58 
 
 		 519 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0138273  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 565 aa  263  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 539 aa  243  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 		 537 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.69 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.44 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.2 
 
 		 509 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.2 
 
 		 509 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.26 
 
 		 541 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 538 aa  233  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.2 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.98 
 
 		 509 aa  228  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  36.25 
 
 		 537 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 		 561 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 		 539 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.96 
 
 		 528 aa  225  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 		 485 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 		 621 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.63 
 
 		 513 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.63 
 
 		 513 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.65 
 
 		 680 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.63 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  30.83 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  30.83 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.86 
 
 		 650 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.83 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 		 682 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 		 682 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 		 682 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.64 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.82 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.02 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.88 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 494 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  29.59 
 
 		 537 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.68 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.39 
 
 		 685 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  29.88 
 
 		 537 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  29.88 
 
 		 537 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  29.88 
 
 		 537 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  29.88 
 
 		 537 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.35 
 
 		 539 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 537 aa  217  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 		 504 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 		 504 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.54 
 
 		 513 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  32.37 
 
 		 476 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  29.59 
 
 		 537 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 		 519 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.69 
 
 		 593 aa  216  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.54 
 
 		 520 aa  216  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.02 
 
 		 504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.02 
 
 		 504 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 		 615 aa  213  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 		 523 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 		 495 aa  213  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.53 
 
 		 562 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.27 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 		 495 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 476 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.71 
 
 		 678 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.89 
 
 		 504 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  34.37 
 
 		 515 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.71 
 
 		 702 aa  209  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>