More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2747 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.57 
 
 
501 aa  816    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
500 aa  968    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0175  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.63 
 
 
502 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000293077  hitchhiker  0.000024964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.32 
 
 
491 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.86 
 
 
565 aa  323  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.62 
 
 
541 aa  317  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.67 
 
 
538 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.45 
 
 
502 aa  309  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 
496 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 
496 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  40.59 
 
 
537 aa  303  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.21 
 
 
537 aa  302  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  34.39 
 
 
537 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  34.21 
 
 
537 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.08 
 
 
495 aa  300  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.26 
 
 
569 aa  299  8e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  33.95 
 
 
537 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.95 
 
 
537 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  39.44 
 
 
537 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  39.44 
 
 
537 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.42 
 
 
538 aa  297  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  39.44 
 
 
537 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  39.44 
 
 
476 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.04 
 
 
489 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.31 
 
 
495 aa  295  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 
491 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.28 
 
 
539 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 
491 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 
497 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.49 
 
 
680 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.43 
 
 
522 aa  289  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.81 
 
 
476 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  41.2 
 
 
486 aa  286  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.91 
 
 
480 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.05 
 
 
561 aa  286  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.8 
 
 
509 aa  285  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.46 
 
 
666 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  35.8 
 
 
507 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  35.8 
 
 
507 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.74 
 
 
479 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  35.61 
 
 
478 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  35.61 
 
 
478 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.77 
 
 
478 aa  282  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  42.09 
 
 
481 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.74 
 
 
479 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 
513 aa  282  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.49 
 
 
504 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.35 
 
 
509 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.79 
 
 
513 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.35 
 
 
509 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.59 
 
 
513 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.39 
 
 
478 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.59 
 
 
513 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.39 
 
 
478 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.81 
 
 
504 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  33.59 
 
 
513 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.59 
 
 
513 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.26 
 
 
469 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.69 
 
 
676 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  33.59 
 
 
513 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.66 
 
 
517 aa  280  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.73 
 
 
535 aa  280  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.71 
 
 
509 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 
511 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.58 
 
 
504 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 
489 aa  279  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.27 
 
 
504 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  33.79 
 
 
511 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.04 
 
 
504 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.04 
 
 
504 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  36.49 
 
 
500 aa  277  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.04 
 
 
519 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.27 
 
 
504 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  35.25 
 
 
511 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
511 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
511 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
448 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 
511 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.82 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.6 
 
 
511 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.98 
 
 
682 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.98 
 
 
682 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.82 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.12 
 
 
511 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.12 
 
 
504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.65 
 
 
685 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 
548 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.62 
 
 
513 aa  273  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.78 
 
 
682 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 
511 aa  273  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.62 
 
 
513 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.48 
 
 
508 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.14 
 
 
504 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.24 
 
 
535 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.18 
 
 
511 aa  270  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.43 
 
 
504 aa  270  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.45 
 
 
525 aa  269  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.29 
 
 
621 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  38.44 
 
 
490 aa  267  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>