More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0668 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  100 
 
 
490 aa  947    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  65.96 
 
 
489 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  64.77 
 
 
486 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  58.25 
 
 
500 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  59.92 
 
 
497 aa  548  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  57.32 
 
 
487 aa  544  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  60.46 
 
 
517 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  53.07 
 
 
496 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  52.85 
 
 
496 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.74 
 
 
491 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.9 
 
 
495 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.7 
 
 
495 aa  332  8e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 
548 aa  329  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  41.88 
 
 
481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 
506 aa  312  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  41.83 
 
 
497 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.4 
 
 
502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.03 
 
 
495 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  39.2 
 
 
488 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 
491 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  38.25 
 
 
448 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.79 
 
 
489 aa  296  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 
501 aa  295  9e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
491 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 
500 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 
523 aa  295  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.4 
 
 
500 aa  293  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.22 
 
 
478 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.22 
 
 
478 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.22 
 
 
478 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 
480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  34.22 
 
 
478 aa  289  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  34.02 
 
 
478 aa  289  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.6 
 
 
479 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.6 
 
 
479 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.38 
 
 
469 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.75 
 
 
476 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.55 
 
 
541 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.14 
 
 
569 aa  269  7e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 
538 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7581  putative multidrug transport protein  40.84 
 
 
477 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.2 
 
 
511 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.1 
 
 
535 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.03 
 
 
523 aa  256  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 
484 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 
480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 
487 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 
449 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.26 
 
 
431 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
513 aa  250  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  33.81 
 
 
513 aa  250  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  33.81 
 
 
513 aa  250  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
513 aa  250  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.81 
 
 
513 aa  250  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.57 
 
 
513 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
513 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.33 
 
 
513 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  35.95 
 
 
515 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.57 
 
 
513 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  36.31 
 
 
501 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 
513 aa  247  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.15 
 
 
535 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 
539 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0175  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.45 
 
 
502 aa  243  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000293077  hitchhiker  0.000024964 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.04 
 
 
538 aa  242  9e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
450 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.01 
 
 
522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.58 
 
 
666 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  32.06 
 
 
507 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  28.79 
 
 
537 aa  239  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  28.79 
 
 
537 aa  239  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  28.79 
 
 
537 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  28.79 
 
 
537 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.79 
 
 
537 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  30.86 
 
 
507 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  28.98 
 
 
537 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.61 
 
 
485 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.73 
 
 
537 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  28.6 
 
 
537 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.65 
 
 
593 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  29.74 
 
 
476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.61 
 
 
526 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 
607 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.61 
 
 
526 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.99 
 
 
554 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 
511 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  33.01 
 
 
511 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 
511 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.02 
 
 
592 aa  234  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.85 
 
 
511 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.99 
 
 
483 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 
511 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 
483 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  31.9 
 
 
511 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 
531 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.07 
 
 
685 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.99 
 
 
483 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  34.35 
 
 
537 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.88 
 
 
565 aa  229  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>