More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1560 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 498 aa  914    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  52.04 
 
 		 461 aa  319  7.999999999999999e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  51.73 
 
 		 465 aa  312  7.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 		 489 aa  249  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  42.77 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  40.47 
 
 		 462 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  45.66 
 
 		 465 aa  231  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  41.8 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 445 aa  226  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  40.72 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  36.69 
 
 		 462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 469 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 461 aa  210  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 515 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  37.74 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  27.62 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  37.53 
 
 		 492 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 500 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.79 
 
 		 535 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 		 565 aa  104  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.15 
 
 		 491 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 487 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 		 569 aa  95.9  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 		 497 aa  93.6  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 500 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.99 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  27.34 
 
 		 548 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 506 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.49 
 
 		 517 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.15 
 
 		 541 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 478 aa  89.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 		 448 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 480 aa  87.8  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 		 501 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 484 aa  87.4  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 490 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3297  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.48 
 
 		 539 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.7 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 481 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.64 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  28.57 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.81 
 
 		 539 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.46 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.94 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.94 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 539 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 484 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  22.3 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.55 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  22.3 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 531 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 531 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  22.3 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.86 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  22.3 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  22.3 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.45 
 
 		 555 aa  77.8  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.33 
 
 		 523 aa  77.4  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.49 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1830  major facilitator superfamily drug efflux transporter  32.66 
 
 		 538 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.67 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.08 
 
 		 685 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.68 
 
 		 592 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  21.97 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.26 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4062  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.27 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.67 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.49 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.63 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.19 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  20.79 
 
 		 513 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>