More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1220 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 450 aa  903    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  84.34 
 
 		 449 aa  757    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.35 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 		 495 aa  266  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.56 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 448 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.94 
 
 		 539 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.15 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 496 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 		 523 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 548 aa  259  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 500 aa  259  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 486 aa  252  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 		 666 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 488 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.78 
 
 		 489 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 500 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 497 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.65 
 
 		 495 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 491 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 497 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.55 
 
 		 506 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.58 
 
 		 680 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  33.26 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  33.26 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 489 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 478 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 478 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 478 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.79 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.7 
 
 		 569 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 476 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.03 
 
 		 565 aa  240  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.37 
 
 		 541 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.55 
 
 		 479 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 501 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.34 
 
 		 523 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 490 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.52 
 
 		 517 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 487 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.71 
 
 		 513 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  35.71 
 
 		 513 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  35.71 
 
 		 513 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.71 
 
 		 513 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.6 
 
 		 538 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.71 
 
 		 513 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.71 
 
 		 513 aa  236  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 500 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.71 
 
 		 513 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.78 
 
 		 469 aa  236  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.16 
 
 		 513 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.16 
 
 		 513 aa  236  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.91 
 
 		 513 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 504 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 		 480 aa  232  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.32 
 
 		 561 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.37 
 
 		 504 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.66 
 
 		 511 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.86 
 
 		 504 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.61 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.16 
 
 		 676 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.57 
 
 		 672 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.61 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.01 
 
 		 535 aa  229  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.45 
 
 		 537 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.1 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.28 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  32.2 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.86 
 
 		 509 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  31.96 
 
 		 537 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  31.8 
 
 		 476 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  31.8 
 
 		 537 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  31.8 
 
 		 537 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  31.8 
 
 		 537 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  31.8 
 
 		 537 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.33 
 
 		 504 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.33 
 
 		 504 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.33 
 
 		 504 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.33 
 
 		 504 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 		 554 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  33.73 
 
 		 507 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 		 504 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.44 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.07 
 
 		 504 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.08 
 
 		 519 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.45 
 
 		 697 aa  223  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.63 
 
 		 522 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 		 504 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 538 aa  223  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  34.12 
 
 		 507 aa  223  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 484 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 		 504 aa  222  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7581  putative multidrug transport protein  33.75 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.68 
 
 		 592 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.08 
 
 		 504 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  36.71 
 
 		 666 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.79 
 
 		 511 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>