More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2504 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 501 aa  969    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.57 
 
 		 500 aa  834    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0175  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.2 
 
 		 502 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000293077  hitchhiker  0.000024964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.04 
 
 		 491 aa  343  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.57 
 
 		 541 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38 
 
 		 538 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 		 565 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.36 
 
 		 502 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 		 496 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 		 537 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  34.39 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.16 
 
 		 489 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  34.51 
 
 		 537 aa  300  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 		 497 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  34.87 
 
 		 537 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.44 
 
 		 537 aa  299  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.55 
 
 		 569 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 486 aa  295  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.33 
 
 		 538 aa  295  9e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.46 
 
 		 539 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 		 491 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  34.72 
 
 		 537 aa  293  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  34.72 
 
 		 537 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  34.72 
 
 		 537 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.07 
 
 		 517 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  39.67 
 
 		 476 aa  292  9e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.68 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  39.03 
 
 		 537 aa  288  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.77 
 
 		 480 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.91 
 
 		 476 aa  287  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 		 489 aa  286  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.45 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.45 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.71 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.96 
 
 		 561 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.55 
 
 		 495 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.93 
 
 		 478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 		 513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 		 513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  34.51 
 
 		 513 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.51 
 
 		 513 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  34.51 
 
 		 513 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.86 
 
 		 479 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.51 
 
 		 513 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  35.73 
 
 		 478 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  35.73 
 
 		 478 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.32 
 
 		 666 aa  282  8.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.86 
 
 		 479 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.52 
 
 		 478 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.52 
 
 		 478 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  40.75 
 
 		 535 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 500 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.24 
 
 		 522 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.58 
 
 		 511 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.39 
 
 		 469 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  37.18 
 
 		 511 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 490 aa  280  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 		 511 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 		 511 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.55 
 
 		 509 aa  279  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.27 
 
 		 680 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.27 
 
 		 511 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.76 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.46 
 
 		 504 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.46 
 
 		 504 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.24 
 
 		 504 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.24 
 
 		 519 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.24 
 
 		 504 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  34.58 
 
 		 511 aa  276  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.2 
 
 		 511 aa  276  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41 
 
 		 504 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 		 513 aa  276  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.11 
 
 		 535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.55 
 
 		 509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.55 
 
 		 509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.13 
 
 		 511 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.74 
 
 		 511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.15 
 
 		 504 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
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NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.02 
 
 		 504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.02 
 
 		 504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  35.19 
 
 		 507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.18 
 
 		 511 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.97 
 
 		 504 aa  273  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
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NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  34.77 
 
 		 507 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.26 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 537 aa  269  8.999999999999999e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.11 
 
 		 509 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
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NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.19 
 
 		 676 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.21 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
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NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 487 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.72 
 
 		 504 aa  267  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
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NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.69 
 
 		 505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
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NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 685 aa  266  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.73 
 
 		 504 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 		 526 aa  266  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
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