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for query gene Noca_2169 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 554 aa  1093    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.91 
 
 		 526 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.44 
 
 		 569 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.58 
 
 		 666 aa  490  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  50.2 
 
 		 535 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  53 
 
 		 538 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
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NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  45.86 
 
 		 584 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.22 
 
 		 850 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.63 
 
 		 680 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.69 
 
 		 672 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.8 
 
 		 558 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.89 
 
 		 678 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.9 
 
 		 676 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.21 
 
 		 650 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  45.76 
 
 		 571 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.27 
 
 		 682 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.75 
 
 		 525 aa  435  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.89 
 
 		 682 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.89 
 
 		 682 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.42 
 
 		 685 aa  435  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_4620  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.7 
 
 		 566 aa  432  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226241  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  49.79 
 
 		 666 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.39 
 
 		 534 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.13 
 
 		 525 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.15 
 
 		 524 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.96 
 
 		 504 aa  425  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
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NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.7 
 
 		 685 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.22 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.31 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.01 
 
 		 504 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
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NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.84 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.38 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.16 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.38 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.38 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
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NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.21 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.81 
 
 		 523 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.7 
 
 		 509 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
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NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.1 
 
 		 531 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.91 
 
 		 528 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
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NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.7 
 
 		 697 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.99 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.18 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.57 
 
 		 539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.99 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.15 
 
 		 519 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.78 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.78 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.36 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.99 
 
 		 504 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  44.07 
 
 		 535 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.71 
 
 		 522 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.91 
 
 		 575 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.43 
 
 		 513 aa  399  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  46.22 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.44 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.45 
 
 		 593 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19560  arabinose efflux permease family protein  45.38 
 
 		 552 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.301888  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.03 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0773  major facilitator transporter  45.67 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.54 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.54 
 
 		 567 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.28 
 
 		 555 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.32 
 
 		 530 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.54 
 
 		 538 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  40.65 
 
 		 1062 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2523  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 		 551 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.66 
 
 		 528 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.12 
 
 		 607 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.98 
 
 		 532 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33640  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.57 
 
 		 575 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.82 
 
 		 641 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.17 
 
 		 522 aa  378  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2369  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.2 
 
 		 555 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01490  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.95 
 
 		 624 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.8 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2821  major facilitator superfamily MFS_1  43.98 
 
 		 544 aa  372  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.68 
 
 		 592 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.6 
 
 		 526 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0970  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.64 
 
 		 737 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.3 
 
 		 514 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.98 
 
 		 592 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11905  integral membrane protein  42.58 
 
 		 687 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.33 
 
 		 685 aa  369  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
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NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.15 
 
 		 524 aa  360  3e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5709  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 578 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494905  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0854  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.6 
 
 		 711 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.95 
 
 		 575 aa  357  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.15 
 
 		 528 aa  355  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.09 
 
 		 562 aa  354  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.79 
 
 		 541 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.45 
 
 		 565 aa  345  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.42 
 
 		 538 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_3777  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.19 
 
 		 554 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4865  major facilitator superfamily MFS_1  46.76 
 
 		 477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  45.28 
 
 		 515 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  42.21 
 
 		 501 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
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NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.25 
 
 		 523 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.28 
 
 		 918 aa  332  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
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