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for query gene Strop_3709 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  89.88 
 
 		 523 aa  825    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 522 aa  1016    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64 
 
 		 528 aa  634  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.61 
 
 		 525 aa  537  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.51 
 
 		 666 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.91 
 
 		 516 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.99 
 
 		 680 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  49.08 
 
 		 666 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.4 
 
 		 682 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.45 
 
 		 528 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.4 
 
 		 682 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.4 
 
 		 682 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.74 
 
 		 558 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.3 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.23 
 
 		 685 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.93 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.53 
 
 		 650 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.42 
 
 		 697 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.11 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.09 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.17 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.01 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.8 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.14 
 
 		 685 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.38 
 
 		 678 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.64 
 
 		 509 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.38 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.82 
 
 		 554 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.66 
 
 		 676 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.68 
 
 		 504 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.96 
 
 		 509 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.74 
 
 		 505 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.96 
 
 		 509 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.11 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.89 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  43.91 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44 
 
 		 520 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.89 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.89 
 
 		 504 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.89 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.68 
 
 		 504 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.68 
 
 		 504 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.17 
 
 		 501 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.07 
 
 		 513 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.26 
 
 		 525 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.67 
 
 		 672 aa  387  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.56 
 
 		 607 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.15 
 
 		 567 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.37 
 
 		 526 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.35 
 
 		 538 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.39 
 
 		 535 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39 
 
 		 557 aa  362  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.35 
 
 		 532 aa  358  9.999999999999999e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 491 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  37.69 
 
 		 537 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 		 537 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.4 
 
 		 592 aa  354  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.52 
 
 		 530 aa  352  8.999999999999999e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.92 
 
 		 641 aa  352  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  36.72 
 
 		 537 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  36.53 
 
 		 537 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.84 
 
 		 523 aa  349  6e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  37.67 
 
 		 537 aa  349  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  37.67 
 
 		 537 aa  349  8e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  37.67 
 
 		 537 aa  349  8e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 		 537 aa  347  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.04 
 
 		 522 aa  347  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.98 
 
 		 555 aa  346  7e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.81 
 
 		 541 aa  346  8e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  41.2 
 
 		 535 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  42.14 
 
 		 476 aa  343  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.57 
 
 		 538 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.45 
 
 		 514 aa  342  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.15 
 
 		 534 aa  342  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.92 
 
 		 524 aa  341  2e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.92 
 
 		 531 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.6 
 
 		 575 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.76 
 
 		 528 aa  333  6e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.41 
 
 		 538 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.89 
 
 		 539 aa  327  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  41.79 
 
 		 537 aa  326  8.000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_11905  integral membrane protein  40.52 
 
 		 687 aa  326  8.000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  38.1 
 
 		 1062 aa  325  9e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.83 
 
 		 572 aa  325  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.49 
 
 		 526 aa  325  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2369  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.16 
 
 		 555 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.618021 
 
 
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NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.11 
 
 		 592 aa  323  4e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.852197 
 
 
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NC_013441  Gbro_4620  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.27 
 
 		 566 aa  322  8e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226241  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.8 
 
 		 524 aa  322  9.000000000000001e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.36 
 
 		 850 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.03 
 
 		 565 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.99 
 
 		 561 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.59 
 
 		 519 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
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NC_008010  Dgeo_2674  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.66 
 
 		 684 aa  316  6e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.07 
 
 		 571 aa  316  8e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.06 
 
 		 485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
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NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.57 
 
 		 522 aa  313  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
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NC_011898  Ccel_0411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 		 531 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_33640  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.75 
 
 		 575 aa  312  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179116  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_19560  arabinose efflux permease family protein  39.38 
 
 		 552 aa  310  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.301888  normal  0.424094 
 
 
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