More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3774 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  100 
 
 		 465 aa  871    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  75.59 
 
 		 461 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  52.77 
 
 		 498 aa  355  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 483 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  44.32 
 
 		 462 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  44.77 
 
 		 489 aa  276  8e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  49.12 
 
 		 465 aa  269  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 445 aa  266  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  42.15 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  42.24 
 
 		 495 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  38.83 
 
 		 462 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 		 515 aa  236  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 		 452 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  42.46 
 
 		 471 aa  203  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  29.86 
 
 		 468 aa  176  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  35.41 
 
 		 492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.53 
 
 		 535 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  24.27 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.99 
 
 		 569 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.3 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 491 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 491 aa  93.6  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 449 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.61 
 
 		 489 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.95 
 
 		 502 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.29 
 
 		 528 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.7 
 
 		 615 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.61 
 
 		 500 aa  90.1  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 495 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.74 
 
 		 539 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.43 
 
 		 495 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  28.28 
 
 		 1062 aa  87  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 497 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 501 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.82 
 
 		 517 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.73 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.29 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0727  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.12 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  27.79 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.64 
 
 		 565 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.38 
 
 		 555 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 496 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 243 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  25.72 
 
 		 548 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.75 
 
 		 565 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.82 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.03 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 918 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4552  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3480  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.54 
 
 		 621 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  26.82 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.94 
 
 		 697 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.62 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.74 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.87 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.05 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  23.74 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  28.99 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3297  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.08 
 
 		 890 aa  73.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.7 
 
 		 685 aa  73.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.84 
 
 		 536 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.6 
 
 		 513 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.17 
 
 		 504 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>