More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1202 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  82.55 
 
 		 554 aa  909    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 536 aa  1073    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  71.98 
 
 		 531 aa  750    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  60.22 
 
 		 525 aa  625  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.4 
 
 		 530 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.66 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.73 
 
 		 539 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  40.73 
 
 		 539 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.47 
 
 		 534 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.73 
 
 		 539 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 526 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.35 
 
 		 539 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  40.35 
 
 		 539 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.51 
 
 		 530 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  40.35 
 
 		 539 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.72 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  40.35 
 
 		 539 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.51 
 
 		 530 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.51 
 
 		 530 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.8 
 
 		 516 aa  375  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.1 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.04 
 
 		 529 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.21 
 
 		 537 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.88 
 
 		 532 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.24 
 
 		 519 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.04 
 
 		 525 aa  359  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.78 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.62 
 
 		 530 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.83 
 
 		 515 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.1 
 
 		 517 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.01 
 
 		 517 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.59 
 
 		 515 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.76 
 
 		 532 aa  347  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.28 
 
 		 522 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.77 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.77 
 
 		 526 aa  332  8e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.51 
 
 		 511 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.03 
 
 		 515 aa  310  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.44 
 
 		 508 aa  309  6.999999999999999e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 511 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  36.9 
 
 		 511 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  36.9 
 
 		 511 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  35.25 
 
 		 512 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  35.05 
 
 		 512 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  35.05 
 
 		 512 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.23 
 
 		 510 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  35.05 
 
 		 512 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  35.84 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.84 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  35.84 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  35.84 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  35.84 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  35.84 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.84 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.37 
 
 		 544 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  35.84 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.33 
 
 		 514 aa  296  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.38 
 
 		 511 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 516 aa  296  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 		 513 aa  295  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 527 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 527 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.53 
 
 		 526 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  35.7 
 
 		 515 aa  289  8e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  36.51 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.88 
 
 		 513 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.23 
 
 		 526 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.89 
 
 		 539 aa  286  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 		 529 aa  286  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.38 
 
 		 537 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.66 
 
 		 507 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  34.65 
 
 		 512 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  34.8 
 
 		 518 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.53 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.6 
 
 		 524 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.66 
 
 		 507 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.53 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 512 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.14 
 
 		 529 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.12 
 
 		 528 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 507 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.65 
 
 		 512 aa  282  9e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  35.65 
 
 		 512 aa  282  9e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.65 
 
 		 512 aa  282  9e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2517  multidrug resistance protein Y  35.65 
 
 		 512 aa  282  9e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.46 
 
 		 511 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_3598  multidrug resistance protein Y  35.43 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0257273 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2736  multidrug resistance protein Y  35.43 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.416223  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.82 
 
 		 512 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 		 523 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.76 
 
 		 494 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.436149 
 
 
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NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 		 512 aa  280  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.98 
 
 		 519 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.98 
 
 		 519 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.98 
 
 		 519 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.98 
 
 		 519 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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