More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01786 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  68.36 
 
 		 531 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  67.48 
 
 		 531 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  100 
 
 		 537 aa  1045    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  67.29 
 
 		 531 aa  692    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3480  major facilitator superfamily MFS_1  87.36 
 
 		 530 aa  882    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.89 
 
 		 532 aa  663    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  66.91 
 
 		 549 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  68.36 
 
 		 531 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  68.74 
 
 		 531 aa  699    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  66.91 
 
 		 549 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4552  major facilitator superfamily MFS_1  87.36 
 
 		 530 aa  882    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4062  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  67.8 
 
 		 531 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  68.02 
 
 		 548 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  68.55 
 
 		 531 aa  698    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  68.22 
 
 		 531 aa  700    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  68.55 
 
 		 531 aa  698    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  69.11 
 
 		 531 aa  705    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  67.29 
 
 		 531 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  66.47 
 
 		 508 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  68.36 
 
 		 531 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  67.29 
 
 		 531 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  66.73 
 
 		 549 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  67.48 
 
 		 531 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4436  major facilitator transporter  55.35 
 
 		 502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7236  major facilitator superfamily MFS_1  50.48 
 
 		 545 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4104  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.06 
 
 		 518 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5307  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.72 
 
 		 530 aa  475  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777594 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0540  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  52.93 
 
 		 502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.380865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1830  major facilitator superfamily drug efflux transporter  51.49 
 
 		 538 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2926  multidrug transporter, putative  51.66 
 
 		 519 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0138273  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 494 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.19 
 
 		 537 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.78 
 
 		 685 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.89 
 
 		 561 aa  239  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.56 
 
 		 541 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.65 
 
 		 682 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.98 
 
 		 538 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 539 aa  235  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.44 
 
 		 682 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.44 
 
 		 682 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.68 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.94 
 
 		 537 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  29.54 
 
 		 537 aa  230  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 538 aa  229  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.87 
 
 		 650 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 		 528 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  29.54 
 
 		 537 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.42 
 
 		 485 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.35 
 
 		 592 aa  227  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  29.54 
 
 		 537 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  29.54 
 
 		 537 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  29.54 
 
 		 537 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  29.54 
 
 		 537 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 537 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 		 678 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  31.72 
 
 		 476 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.01 
 
 		 528 aa  224  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.68 
 
 		 621 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 		 607 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.49 
 
 		 615 aa  220  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.02 
 
 		 513 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.02 
 
 		 513 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 513 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 513 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 		 569 aa  219  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.68 
 
 		 676 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  28.27 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  28.27 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 702 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.27 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 513 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.13 
 
 		 513 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.34 
 
 		 680 aa  217  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 		 504 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.09 
 
 		 530 aa  216  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  32.13 
 
 		 537 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 		 504 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.69 
 
 		 504 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 		 509 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.82 
 
 		 504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 513 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 		 519 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 522 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.86 
 
 		 504 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 		 511 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.49 
 
 		 523 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 500 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.69 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.69 
 
 		 504 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.69 
 
 		 504 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.69 
 
 		 504 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  28.1 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.42 
 
 		 502 aa  211  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 		 509 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.78 
 
 		 697 aa  210  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>