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for query gene Acry_2437 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  100 
 
 		 494 aa  964    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.46 
 
 		 528 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.58 
 
 		 530 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.61 
 
 		 685 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 		 569 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.96 
 
 		 676 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.6 
 
 		 650 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.51 
 
 		 682 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.51 
 
 		 682 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.51 
 
 		 682 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.17 
 
 		 680 aa  296  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.54 
 
 		 535 aa  295  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.63 
 
 		 685 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.8 
 
 		 554 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.67 
 
 		 522 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.3 
 
 		 666 aa  290  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  40.74 
 
 		 513 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.65 
 
 		 538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.37 
 
 		 565 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.02 
 
 		 528 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.44 
 
 		 607 aa  283  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.09 
 
 		 525 aa  282  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.25 
 
 		 539 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.2 
 
 		 672 aa  280  4e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.83 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 		 541 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.83 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 		 523 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.2 
 
 		 528 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  36.7 
 
 		 537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.31 
 
 		 535 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  36.27 
 
 		 501 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.15 
 
 		 697 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.46 
 
 		 526 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.17 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.17 
 
 		 641 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.91 
 
 		 504 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  36.88 
 
 		 515 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.39 
 
 		 483 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.77 
 
 		 539 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.91 
 
 		 505 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.59 
 
 		 565 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05301  integral membrane transmembrane protein  41.52 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.36 
 
 		 498 aa  263  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.62 
 
 		 491 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 		 483 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  38.19 
 
 		 666 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.65 
 
 		 678 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.27 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.27 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.55 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.85 
 
 		 509 aa  261  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.84 
 
 		 537 aa  260  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  34.53 
 
 		 537 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 537 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  34.46 
 
 		 537 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.19 
 
 		 504 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  34.46 
 
 		 537 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  34.46 
 
 		 537 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  34.46 
 
 		 537 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.31 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  34.46 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 537 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.66 
 
 		 504 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5086  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 529 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 		 562 aa  257  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.66 
 
 		 504 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.5 
 
 		 592 aa  257  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.19 
 
 		 561 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 538 aa  256  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.66 
 
 		 519 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.45 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.91 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.45 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 		 509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.45 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.25 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 		 537 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_3058  major facilitator superfamily permease  36.27 
 
 		 527 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0549474  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.68 
 
 		 522 aa  255  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.77 
 
 		 504 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  35.75 
 
 		 477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  33.07 
 
 		 535 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.06 
 
 		 555 aa  252  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.24 
 
 		 593 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_3496  MFS transporter  38.46 
 
 		 531 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597192  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.85 
 
 		 523 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 530 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
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NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.67 
 
 		 557 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.17 
 
 		 520 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 		 513 aa  247  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
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NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 		 538 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.73 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
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NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.2 
 
 		 571 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.61 
 
 		 621 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.44 
 
 		 558 aa  244  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
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NC_007964  Nham_1405  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 519 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.97 
 
 		 567 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
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