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for query gene RS05301 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05301  integral membrane transmembrane protein  100 
 
 		 520 aa  1005    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  85.08 
 
 		 526 aa  834    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  85.08 
 
 		 526 aa  834    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  64.4 
 
 		 513 aa  579  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5086  major facilitator transporter  64.15 
 
 		 529 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.08 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.26 
 
 		 483 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.95 
 
 		 483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  48 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.26 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  46.57 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  48.67 
 
 		 515 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.6 
 
 		 483 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.67 
 
 		 569 aa  297  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.96 
 
 		 528 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 494 aa  291  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.24 
 
 		 554 aa  289  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  40.63 
 
 		 535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.43 
 
 		 685 aa  277  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.88 
 
 		 530 aa  277  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.67 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.67 
 
 		 519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.67 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.67 
 
 		 504 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.67 
 
 		 504 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.42 
 
 		 504 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.42 
 
 		 504 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 		 697 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
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NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.49 
 
 		 528 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.42 
 
 		 504 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.01 
 
 		 528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.94 
 
 		 504 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1405  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 519 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.33 
 
 		 525 aa  266  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.44 
 
 		 680 aa  264  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.27 
 
 		 522 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 650 aa  260  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.14 
 
 		 530 aa  259  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 685 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.94 
 
 		 682 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.95 
 
 		 539 aa  259  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.94 
 
 		 682 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.94 
 
 		 682 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
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NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.09 
 
 		 509 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.1 
 
 		 593 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.71 
 
 		 509 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.71 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.63 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.63 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
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NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.55 
 
 		 562 aa  256  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.78 
 
 		 555 aa  256  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3058  major facilitator superfamily permease  38.04 
 
 		 527 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0549474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 		 565 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.46 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.87 
 
 		 641 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.65 
 
 		 918 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  37.32 
 
 		 1062 aa  254  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.57 
 
 		 666 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 		 676 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 		 565 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.93 
 
 		 504 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.78 
 
 		 526 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 530 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.73 
 
 		 520 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1152  major facilitator transporter  38.45 
 
 		 516 aa  249  7e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0257451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.63 
 
 		 678 aa  249  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.81 
 
 		 685 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.41 
 
 		 504 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.88 
 
 		 541 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 		 538 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.78 
 
 		 607 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1340  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 614 aa  246  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.407656  normal  0.251685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.6 
 
 		 528 aa  246  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.36 
 
 		 672 aa  246  9e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.25 
 
 		 621 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 		 513 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.74 
 
 		 535 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.59 
 
 		 539 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.66 
 
 		 491 aa  243  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 		 592 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.15 
 
 		 615 aa  242  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  38.15 
 
 		 666 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.93 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 		 534 aa  240  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 523 aa  239  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 501 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.54 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  34.7 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3998  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.68 
 
 		 550 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2086  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 547 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389714  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_1542  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 498 aa  237  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2009  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 512 aa  236  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.192597 
 
 
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NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.39 
 
 		 575 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
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NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.58 
 
 		 538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.85 
 
 		 571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 		 850 aa  234  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.46 
 
 		 523 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
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NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.63 
 
 		 522 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
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