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for query gene Sros_4211 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 491 aa  918    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.26 
 
 		 569 aa  316  8e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.56 
 
 		 685 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.01 
 
 		 682 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.01 
 
 		 682 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.01 
 
 		 682 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.78 
 
 		 685 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.27 
 
 		 676 aa  296  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.26 
 
 		 680 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  40.83 
 
 		 535 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.25 
 
 		 650 aa  285  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  41.81 
 
 		 666 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.23 
 
 		 535 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.59 
 
 		 561 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.95 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.49 
 
 		 697 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 		 525 aa  279  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.01 
 
 		 539 aa  279  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.34 
 
 		 522 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.64 
 
 		 678 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 		 607 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.39 
 
 		 526 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.51 
 
 		 666 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.63 
 
 		 523 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 		 641 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.6 
 
 		 592 aa  263  8e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 494 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.03 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.22 
 
 		 541 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.41 
 
 		 516 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 511 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.62 
 
 		 554 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  33.41 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 565 aa  257  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.67 
 
 		 501 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.96 
 
 		 538 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.1 
 
 		 525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.07 
 
 		 523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.94 
 
 		 511 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.94 
 
 		 511 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35 
 
 		 565 aa  253  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.1 
 
 		 672 aa  253  6e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.94 
 
 		 511 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  32.94 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 		 504 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 		 491 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.99 
 
 		 571 aa  249  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.64 
 
 		 534 aa  249  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 		 504 aa  249  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.83 
 
 		 592 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.41 
 
 		 513 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 584 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.23 
 
 		 511 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.24 
 
 		 528 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.26 
 
 		 509 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.26 
 
 		 509 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.64 
 
 		 522 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 		 530 aa  246  6.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.4 
 
 		 524 aa  246  8e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 		 504 aa  246  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 		 509 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.88 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.63 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.8 
 
 		 504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 		 513 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.32 
 
 		 504 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.41 
 
 		 511 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  32.37 
 
 		 537 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.79 
 
 		 513 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.79 
 
 		 513 aa  242  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  32.13 
 
 		 537 aa  242  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.02 
 
 		 530 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.18 
 
 		 511 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.6 
 
 		 593 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.18 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.04 
 
 		 501 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.19 
 
 		 513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  31.42 
 
 		 513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  31.42 
 
 		 513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.42 
 
 		 513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  34.64 
 
 		 535 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.65 
 
 		 513 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 		 504 aa  240  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4620  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.14 
 
 		 566 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226241  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 537 aa  240  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 		 504 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 		 504 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  32.52 
 
 		 507 aa  239  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.95 
 
 		 572 aa  239  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal  1 
 
 
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NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 		 504 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 		 504 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.94 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.28 
 
 		 538 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  32.28 
 
 		 507 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.73 
 
 		 562 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.57 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
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