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for query gene Francci3_0717 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 558 aa  1078    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  64.27 
 
 		 666 aa  571  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.62 
 
 		 672 aa  542  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  59.45 
 
 		 666 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  58.04 
 
 		 676 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.32 
 
 		 680 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
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NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.15 
 
 		 569 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.83 
 
 		 678 aa  495  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.53 
 
 		 682 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.53 
 
 		 682 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.73 
 
 		 682 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.1 
 
 		 685 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.13 
 
 		 685 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.26 
 
 		 650 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.06 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.49 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.93 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.42 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.03 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
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NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.15 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
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NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.67 
 
 		 504 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.92 
 
 		 509 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
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NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.43 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.48 
 
 		 504 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.43 
 
 		 519 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  51.17 
 
 		 520 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
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NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.15 
 
 		 509 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.39 
 
 		 504 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
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NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.96 
 
 		 509 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.96 
 
 		 509 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.43 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.43 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.43 
 
 		 697 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
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NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.8 
 
 		 554 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.22 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.22 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.43 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.37 
 
 		 525 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
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NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.12 
 
 		 528 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
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NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  48.19 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
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NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.67 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.72 
 
 		 528 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.12 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
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NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.14 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
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NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.83 
 
 		 523 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
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NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.22 
 
 		 567 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
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NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.3 
 
 		 535 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.72 
 
 		 525 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.56 
 
 		 538 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.86 
 
 		 526 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
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NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.65 
 
 		 572 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.34 
 
 		 532 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_11905  integral membrane protein  45.64 
 
 		 687 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.03 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.51 
 
 		 555 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.54 
 
 		 575 aa  378  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.8 
 
 		 539 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.71 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.44 
 
 		 685 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.41 
 
 		 592 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.8 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.73 
 
 		 530 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.55 
 
 		 607 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 491 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  39.41 
 
 		 537 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.34 
 
 		 523 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  39.96 
 
 		 1062 aa  363  5.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  42.95 
 
 		 538 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.65 
 
 		 641 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2674  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.35 
 
 		 684 aa  356  5e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.42 
 
 		 524 aa  354  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.18 
 
 		 562 aa  353  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.66 
 
 		 534 aa  350  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.12 
 
 		 565 aa  349  6e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.49 
 
 		 592 aa  348  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.45 
 
 		 541 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.77 
 
 		 615 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.46 
 
 		 850 aa  348  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.43 
 
 		 593 aa  343  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.28 
 
 		 519 aa  342  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.04 
 
 		 538 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.82 
 
 		 524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  41.57 
 
 		 535 aa  336  5.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.2 
 
 		 531 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012803  Mlut_01490  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.54 
 
 		 624 aa  334  3e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4620  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.4 
 
 		 566 aa  334  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226241  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.91 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
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NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  38.91 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.98 
 
 		 537 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.92 
 
 		 571 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  39.11 
 
 		 511 aa  331  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.91 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.91 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.91 
 
 		 511 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.79 
 
 		 522 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.98 
 
 		 511 aa  330  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.89 
 
 		 621 aa  329  9e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  37.03 
 
 		 537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  36.77 
 
 		 537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
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