More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5086 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5086  major facilitator transporter  100 
 
 
529 aa  1021    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190759  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  81.84 
 
 
513 aa  754    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.82 
 
 
526 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.82 
 
 
526 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05301  integral membrane transmembrane protein  61.95 
 
 
520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  51.43 
 
 
504 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.37 
 
 
483 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.4 
 
 
498 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.42 
 
 
505 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.55 
 
 
483 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.23 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  47.42 
 
 
501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.83 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  45.91 
 
 
515 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  39.46 
 
 
494 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.56 
 
 
528 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.69 
 
 
530 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 
554 aa  296  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  41.15 
 
 
535 aa  293  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.1 
 
 
569 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.26 
 
 
504 aa  280  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.13 
 
 
666 aa  279  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.76 
 
 
528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.91 
 
 
680 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.35 
 
 
685 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.35 
 
 
593 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.51 
 
 
697 aa  269  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.22 
 
 
509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.35 
 
 
504 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 
565 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.36 
 
 
685 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 
682 aa  264  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.23 
 
 
504 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 
682 aa  264  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 
682 aa  264  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.59 
 
 
539 aa  263  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.43 
 
 
650 aa  263  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 
522 aa  259  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.57 
 
 
504 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.57 
 
 
504 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.14 
 
 
504 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 
678 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.82 
 
 
519 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.91 
 
 
504 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.35 
 
 
504 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.35 
 
 
504 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.92 
 
 
555 aa  256  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  38.55 
 
 
530 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.27 
 
 
571 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.66 
 
 
509 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.95 
 
 
509 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 
504 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.95 
 
 
509 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.2 
 
 
504 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.7 
 
 
504 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.16 
 
 
513 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  36.91 
 
 
666 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 
641 aa  246  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.97 
 
 
565 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.1 
 
 
1062 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.51 
 
 
685 aa  246  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.27 
 
 
530 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1340  major facilitator transporter  40.09 
 
 
614 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.407656  normal  0.251685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.88 
 
 
535 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 
672 aa  243  6e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3496  MFS transporter  36.82 
 
 
531 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597192  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1405  major facilitator transporter  37.8 
 
 
519 aa  243  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.08 
 
 
519 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.53 
 
 
520 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1542  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 
498 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.88 
 
 
505 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.61 
 
 
562 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.51 
 
 
501 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.1 
 
 
890 aa  240  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3058  major facilitator superfamily permease  34.87 
 
 
527 aa  240  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0549474  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.72 
 
 
523 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 
528 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19560  arabinose efflux permease family protein  34.86 
 
 
552 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.301888  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.97 
 
 
500 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 
526 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.53 
 
 
918 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.41 
 
 
525 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.14 
 
 
676 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2086  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 
547 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.48 
 
 
485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2009  major facilitator transporter  40.42 
 
 
512 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.06 
 
 
534 aa  236  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  35.19 
 
 
537 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2369  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 
555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.37 
 
 
615 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 
501 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.19 
 
 
491 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1152  major facilitator transporter  35.45 
 
 
516 aa  233  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0257451  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 
448 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
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NC_009565  TBFG_11905  integral membrane protein  33.68 
 
 
687 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  34.15 
 
 
500 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 
850 aa  230  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.02 
 
 
528 aa  230  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2812  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.56 
 
 
1102 aa  229  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.220309 
 
 
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NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 
567 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
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