More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0391 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 530 aa  1039    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.85 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.86 
 
 		 524 aa  505  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.5 
 
 		 528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.48 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.63 
 
 		 592 aa  431  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.04 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.44 
 
 		 567 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.6 
 
 		 538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.25 
 
 		 528 aa  392  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.63 
 
 		 554 aa  385  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.88 
 
 		 532 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.8 
 
 		 678 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.7 
 
 		 592 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.12 
 
 		 682 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.32 
 
 		 554 aa  375  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.12 
 
 		 682 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.12 
 
 		 682 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.92 
 
 		 685 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.06 
 
 		 697 aa  368  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.04 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.97 
 
 		 575 aa  364  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.92 
 
 		 569 aa  364  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.73 
 
 		 650 aa  363  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.12 
 
 		 525 aa  362  6e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.44 
 
 		 535 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.08 
 
 		 685 aa  355  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.09 
 
 		 666 aa  353  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.52 
 
 		 680 aa  350  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.65 
 
 		 522 aa  348  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.44 
 
 		 504 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.03 
 
 		 509 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.03 
 
 		 509 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.34 
 
 		 535 aa  341  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.88 
 
 		 504 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.92 
 
 		 504 aa  340  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.54 
 
 		 528 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.29 
 
 		 509 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.66 
 
 		 504 aa  337  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
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NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.58 
 
 		 558 aa  335  7.999999999999999e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.13 
 
 		 504 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.33 
 
 		 672 aa  333  6e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  42.08 
 
 		 666 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 584 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.19 
 
 		 505 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.6 
 
 		 676 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.5 
 
 		 513 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.79 
 
 		 526 aa  325  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.96 
 
 		 509 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.51 
 
 		 520 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 504 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 504 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 504 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.29 
 
 		 504 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 504 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11905  integral membrane protein  39.88 
 
 		 687 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 519 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.36 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.98 
 
 		 607 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 		 523 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.92 
 
 		 575 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.74 
 
 		 525 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  36.04 
 
 		 535 aa  310  5.9999999999999995e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  36.45 
 
 		 537 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.87 
 
 		 501 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.16 
 
 		 534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.12 
 
 		 523 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.1 
 
 		 621 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.11 
 
 		 504 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.74 
 
 		 524 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.79 
 
 		 565 aa  302  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33640  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.23 
 
 		 575 aa  300  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.71 
 
 		 531 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  33.08 
 
 		 537 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 537 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.09 
 
 		 522 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 		 537 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.65 
 
 		 526 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  33.08 
 
 		 537 aa  296  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 		 538 aa  296  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.93 
 
 		 522 aa  296  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  33.52 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  33.52 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.77 
 
 		 539 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  33.52 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2674  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.24 
 
 		 684 aa  293  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 		 593 aa  293  7e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 491 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_19560  arabinose efflux permease family protein  36.27 
 
 		 552 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.301888  normal  0.424094 
 
 
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NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.29 
 
 		 528 aa  289  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.94 
 
 		 516 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.63 
 
 		 641 aa  289  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.82 
 
 		 562 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  35.28 
 
 		 476 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  37.62 
 
 		 1062 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 538 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2523  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 551 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.69 
 
 		 555 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.67 
 
 		 571 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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