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for query gene Sros_1258 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 485 aa  932    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  55.8 
 
 		 489 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.51 
 
 		 569 aa  334  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.42 
 
 		 522 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.69 
 
 		 528 aa  318  9e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.51 
 
 		 697 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.87 
 
 		 615 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.12 
 
 		 523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.84 
 
 		 621 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.49 
 
 		 561 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  43.03 
 
 		 535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.5 
 
 		 525 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.73 
 
 		 682 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.73 
 
 		 682 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.73 
 
 		 682 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.33 
 
 		 678 aa  303  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.95 
 
 		 539 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.15 
 
 		 565 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.95 
 
 		 680 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.2 
 
 		 516 aa  299  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
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NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  41.67 
 
 		 537 aa  299  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.58 
 
 		 509 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.3 
 
 		 666 aa  297  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.36 
 
 		 685 aa  297  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5733  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 		 494 aa  297  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.883697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.21 
 
 		 504 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.25 
 
 		 509 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.12 
 
 		 538 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.26 
 
 		 509 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.26 
 
 		 509 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.5 
 
 		 504 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.58 
 
 		 504 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.9 
 
 		 523 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2674  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.55 
 
 		 684 aa  291  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.78 
 
 		 530 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.34 
 
 		 685 aa  290  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 		 541 aa  290  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.84 
 
 		 504 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43 
 
 		 535 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.84 
 
 		 504 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.84 
 
 		 504 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.58 
 
 		 504 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.58 
 
 		 504 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.58 
 
 		 519 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.89 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.4 
 
 		 504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.58 
 
 		 504 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.65 
 
 		 650 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.96 
 
 		 558 aa  282  7.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.58 
 
 		 505 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.55 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.25 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.35 
 
 		 538 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.33 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.87 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.77 
 
 		 538 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  39.58 
 
 		 1062 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  37.41 
 
 		 537 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  42.34 
 
 		 666 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  37.41 
 
 		 537 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.93 
 
 		 555 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  37.17 
 
 		 537 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  37.17 
 
 		 537 aa  276  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  37.17 
 
 		 537 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  37.17 
 
 		 537 aa  276  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  37.17 
 
 		 476 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.67 
 
 		 702 aa  276  8e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.17 
 
 		 537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.84 
 
 		 672 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.97 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.18 
 
 		 567 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.08 
 
 		 592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.92 
 
 		 520 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.57 
 
 		 513 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 537 aa  273  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.02 
 
 		 562 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.85 
 
 		 537 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.9 
 
 		 534 aa  269  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.23 
 
 		 593 aa  269  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.49 
 
 		 641 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.83 
 
 		 524 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.87 
 
 		 607 aa  266  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.48 
 
 		 554 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.27 
 
 		 890 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.19 
 
 		 532 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.96 
 
 		 575 aa  260  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.86 
 
 		 500 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012803  Mlut_01490  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.33 
 
 		 624 aa  261  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  38.1 
 
 		 535 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.27 
 
 		 513 aa  259  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 		 513 aa  259  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.8 
 
 		 498 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
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NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  35.14 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  35.14 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.27 
 
 		 513 aa  259  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.14 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.46 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.83 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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