More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1028 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  100 
 
 		 484 aa  934    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  46.69 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  30.75 
 
 		 467 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 467 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 484 aa  170  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 467 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 467 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0485  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4933  transport transmembrane protein  30.07 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3015  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 465 aa  133  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.0182564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3000  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3046  major facilitator superfamily transporter  31.07 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.958092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2807  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 474 aa  130  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 682 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 682 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2324  putative transport transmembrane protein  28.18 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.15 
 
 		 476 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 		 685 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3349  major facilitator superfamily transporter  30.5 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 491 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.45 
 
 		 478 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.45 
 
 		 478 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  27.45 
 
 		 478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 650 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.7 
 
 		 478 aa  114  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.45 
 
 		 469 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.45 
 
 		 478 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.45 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.45 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.48 
 
 		 697 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.46 
 
 		 685 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.76 
 
 		 621 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.11 
 
 		 539 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  25.57 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.43 
 
 		 678 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11650  drug efflux membrane protein  28.87 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.306969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.61 
 
 		 890 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.37 
 
 		 516 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 548 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.35 
 
 		 502 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 		 569 aa  101  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 496 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 497 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 488 aa  100  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.47 
 
 		 525 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.51 
 
 		 537 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  24.51 
 
 		 476 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  24.51 
 
 		 537 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.32 
 
 		 538 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.82 
 
 		 541 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  24.51 
 
 		 537 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  24.51 
 
 		 537 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  24.51 
 
 		 537 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  28.78 
 
 		 515 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 496 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 523 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.81 
 
 		 535 aa  97.1  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3480  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 530 aa  96.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4552  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 530 aa  96.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0244  major facilitator superfamily permease  26.67 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00531035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 531 aa  96.7  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 519 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  24.02 
 
 		 537 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.73 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.76 
 
 		 558 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  26.62 
 
 		 548 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  24.02 
 
 		 537 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 531 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.45 
 
 		 539 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.59 
 
 		 530 aa  95.1  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 500 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 500 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  33.33 
 
 		 501 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03264  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03320)  31.19 
 
 		 571 aa  94  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.591417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 531 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 531 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4436  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 502 aa  94  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.37 
 
 		 463 aa  94  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.07 
 
 		 504 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2444  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 454 aa  93.6  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 457 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 531 aa  93.6  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 531 aa  93.6  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.61 
 
 		 561 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 497 aa  93.2  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.09 
 
 		 517 aa  93.2  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2812  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.65 
 
 		 1102 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.220309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>