More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3015 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3015  major facilitator transporter  100 
 
 
465 aa  882    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.0182564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3000  major facilitator transporter  98.49 
 
 
465 aa  873    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3046  major facilitator superfamily transporter  98.49 
 
 
465 aa  873    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.958092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3349  major facilitator superfamily transporter  73.49 
 
 
473 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11650  drug efflux membrane protein  62.02 
 
 
471 aa  451  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.306969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4933  transport transmembrane protein  48.51 
 
 
479 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2807  major facilitator superfamily MFS_1  49.17 
 
 
474 aa  323  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  40.42 
 
 
467 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  40.57 
 
 
467 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  38.06 
 
 
474 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  38.33 
 
 
467 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  39.17 
 
 
467 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  39.17 
 
 
467 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  38.9 
 
 
484 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0485  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 
486 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  31.94 
 
 
474 aa  220  5e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 
479 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  31.83 
 
 
492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2324  putative transport transmembrane protein  51.19 
 
 
475 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  31.26 
 
 
484 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  31.62 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 
680 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.85 
 
 
697 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 
531 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.22 
 
 
685 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 
500 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 
678 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.12 
 
 
650 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  28.81 
 
 
531 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  28.81 
 
 
531 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  29.3 
 
 
469 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  28.81 
 
 
531 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  28.94 
 
 
531 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  30.75 
 
 
497 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  28.4 
 
 
531 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  29.26 
 
 
531 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 
549 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.34 
 
 
539 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  30.12 
 
 
531 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  30.12 
 
 
531 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.37 
 
 
508 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  25.15 
 
 
445 aa  97.8  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.04 
 
 
501 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.06 
 
 
541 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 
682 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 
682 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  27.62 
 
 
531 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
548 aa  97.8  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 
682 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  27.71 
 
 
548 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.64 
 
 
511 aa  96.3  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.25 
 
 
519 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 
531 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 
549 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.27 
 
 
592 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.88 
 
 
531 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  28.39 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.88 
 
 
549 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.9 
 
 
685 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.88 
 
 
531 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4062  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.67 
 
 
531 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671789  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.76 
 
 
495 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.94 
 
 
538 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.41 
 
 
513 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.51 
 
 
495 aa  93.2  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  24.45 
 
 
537 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  23.27 
 
 
513 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  23.27 
 
 
513 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.27 
 
 
513 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.27 
 
 
513 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.41 
 
 
513 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  24.39 
 
 
537 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.27 
 
 
513 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.93 
 
 
504 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  23.9 
 
 
476 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.27 
 
 
513 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.95 
 
 
565 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.27 
 
 
513 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.27 
 
 
513 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.9 
 
 
537 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  23.9 
 
 
537 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  23.9 
 
 
537 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  23.9 
 
 
537 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  23.9 
 
 
537 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 
491 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  25.83 
 
 
500 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 
532 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  26.18 
 
 
478 aa  91.3  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.69 
 
 
476 aa  90.5  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  28.4 
 
 
666 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 
478 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 
478 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  24.75 
 
 
478 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.44 
 
 
676 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 
500 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.75 
 
 
469 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  24.75 
 
 
478 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.16 
 
 
535 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  26.88 
 
 
515 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.72 
 
 
537 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>