More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0057 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  100 
 
 		 478 aa  939    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.25 
 
 		 478 aa  521  1e-146  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.33 
 
 		 471 aa  508  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  50.95 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.13 
 
 		 469 aa  405  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 477 aa  374  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.64 
 
 		 493 aa  369  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.62 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.26 
 
 		 487 aa  237  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.04 
 
 		 482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 570 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  32.46 
 
 		 576 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 465 aa  194  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.34 
 
 		 475 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.05 
 
 		 477 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3504  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 578 aa  193  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 512 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  30.72 
 
 		 458 aa  190  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 582 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.37 
 
 		 477 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 560 aa  189  9e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.79 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.23 
 
 		 493 aa  186  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 		 495 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 573 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.27 
 
 		 534 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 581 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 472 aa  183  6e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.8 
 
 		 522 aa  183  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1098  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 591 aa  182  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.948323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  29.25 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.26 
 
 		 509 aa  182  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 589 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.09 
 
 		 478 aa  180  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 		 493 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  27.24 
 
 		 592 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.89 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 641 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.29 
 
 		 500 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.36 
 
 		 483 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  27.19 
 
 		 508 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.76 
 
 		 478 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 596 aa  177  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0084  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 589 aa  176  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0483176  normal  0.0703431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0555  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 587 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0565  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 587 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0577  major facilitator superfamily transporter  32.57 
 
 		 587 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.410817  decreased coverage  0.00469629 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  30.36 
 
 		 465 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.46 
 
 		 540 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 476 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 608 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.22 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  30.29 
 
 		 462 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 		 496 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 466 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 		 474 aa  169  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.24 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.6 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 		 482 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2321  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 582 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.42 
 
 		 505 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.04 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 		 482 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 		 545 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 		 609 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.1 
 
 		 505 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1554  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 610 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.36 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 498 aa  161  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 476 aa  160  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  29.57 
 
 		 579 aa  160  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 497 aa  160  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 456 aa  160  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.85 
 
 		 607 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.1 
 
 		 520 aa  159  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.92 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.26 
 
 		 535 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.43 
 
 		 489 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  30.11 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 514 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.18 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.18 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.18 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.79 
 
 		 646 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.18 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.79 
 
 		 646 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>