More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1959 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
484 aa  923    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2289  major facilitator transporter  47.1 
 
 
485 aa  295  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00392793  hitchhiker  0.000728467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0670  major facilitator transporter  45.43 
 
 
484 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12328  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
476 aa  266  7e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 
460 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.25 
 
 
474 aa  249  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
483 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.23 
 
 
475 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.83 
 
 
461 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.61 
 
 
477 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.94 
 
 
477 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
579 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.42 
 
 
500 aa  225  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.96 
 
 
456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 
465 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 
483 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.31 
 
 
482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.41 
 
 
496 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 
493 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.01 
 
 
462 aa  206  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 
501 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 
482 aa  203  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 
475 aa  203  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  32.03 
 
 
462 aa  203  7e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 
478 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 
514 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.85 
 
 
497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.69 
 
 
529 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 
486 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6010  major facilitator superfamily MFS_1  56.96 
 
 
450 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.03 
 
 
478 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.69 
 
 
529 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  31.67 
 
 
470 aa  196  9e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 
529 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.49 
 
 
478 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 
482 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.83 
 
 
478 aa  194  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.04 
 
 
607 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 
528 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 
472 aa  193  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.13 
 
 
524 aa  193  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.21 
 
 
482 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  31.62 
 
 
498 aa  189  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.82 
 
 
540 aa  189  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  31.62 
 
 
484 aa  189  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  33.64 
 
 
476 aa  188  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 
495 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.53 
 
 
522 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  33.33 
 
 
466 aa  186  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.95 
 
 
489 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  31.97 
 
 
457 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  31.97 
 
 
457 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
457 aa  186  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  31.97 
 
 
457 aa  186  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  31.97 
 
 
457 aa  186  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  31.97 
 
 
457 aa  186  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  31.97 
 
 
457 aa  186  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  30.67 
 
 
455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  30.67 
 
 
455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  30.67 
 
 
455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  31.97 
 
 
457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  31.73 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  33.09 
 
 
470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 
541 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  30.47 
 
 
480 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  31.89 
 
 
455 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  31.89 
 
 
455 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.8 
 
 
510 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  32.62 
 
 
457 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 
509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.75 
 
 
487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 
491 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  34.86 
 
 
503 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1318  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
474 aa  180  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.98 
 
 
467 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  30.6 
 
 
478 aa  179  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  33.02 
 
 
464 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.48 
 
 
477 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.65 
 
 
512 aa  179  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.78 
 
 
505 aa  179  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  34.4 
 
 
476 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
522 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.93 
 
 
502 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  30.13 
 
 
465 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  30.13 
 
 
465 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  29.62 
 
 
474 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 
485 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
457 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  28.28 
 
 
458 aa  177  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.86 
 
 
464 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.26 
 
 
469 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 
478 aa  176  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.7 
 
 
534 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 
558 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.04 
 
 
514 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  31.06 
 
 
474 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 
459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 
543 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0059  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.976428  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>