More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0493 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
478 aa  945    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  58.05 
 
 
475 aa  530  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.41 
 
 
493 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.98 
 
 
477 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.37 
 
 
482 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.26 
 
 
482 aa  338  9e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  38.36 
 
 
458 aa  286  7e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.82 
 
 
475 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.77 
 
 
474 aa  262  8.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.75 
 
 
482 aa  250  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 
477 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.84 
 
 
477 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 
456 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 
465 aa  240  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.59 
 
 
483 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.88 
 
 
501 aa  233  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  33.09 
 
 
462 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.01 
 
 
486 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 
483 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.14 
 
 
461 aa  226  9e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
496 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.89 
 
 
500 aa  222  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  33.82 
 
 
462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.73 
 
 
474 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 
495 aa  209  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 
491 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  32.6 
 
 
476 aa  203  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.12 
 
 
478 aa  202  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.97 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 
487 aa  200  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  28.6 
 
 
503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 
488 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  30.79 
 
 
470 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  29.61 
 
 
477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 
522 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  29.39 
 
 
510 aa  195  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
446 aa  194  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 
478 aa  189  8e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  27.21 
 
 
473 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  30.56 
 
 
492 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  29.44 
 
 
470 aa  187  5e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  27.35 
 
 
465 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.24 
 
 
512 aa  186  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  28.08 
 
 
487 aa  186  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  27.35 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  27.8 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  31.11 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
457 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.64 
 
 
471 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  31.11 
 
 
457 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  31.11 
 
 
457 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  28.64 
 
 
479 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  31.11 
 
 
457 aa  184  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  31.11 
 
 
457 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  30.86 
 
 
457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  28.54 
 
 
461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  29.15 
 
 
488 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  30.86 
 
 
457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
502 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.18 
 
 
514 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.97 
 
 
482 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  30.86 
 
 
457 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  29.09 
 
 
478 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.58 
 
 
480 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.17 
 
 
504 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  29.17 
 
 
466 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  29.35 
 
 
486 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.3 
 
 
469 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  28.63 
 
 
465 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  28.29 
 
 
457 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.54 
 
 
520 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  29.3 
 
 
475 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  28.29 
 
 
455 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.57 
 
 
529 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  28.29 
 
 
455 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.64 
 
 
478 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.07 
 
 
455 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  28.29 
 
 
455 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.26 
 
 
521 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.96 
 
 
474 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 
452 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 
537 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  28.4 
 
 
474 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  26.9 
 
 
472 aa  176  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.88 
 
 
534 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  29.48 
 
 
537 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  28.36 
 
 
477 aa  176  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
570 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 
478 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 
484 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  27.65 
 
 
456 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.5 
 
 
539 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.88 
 
 
515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.44 
 
 
509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 
685 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  28.01 
 
 
490 aa  174  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  30.27 
 
 
484 aa  173  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>