More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1253 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  98.13 
 
 
482 aa  932    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
482 aa  946    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.55 
 
 
493 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.82 
 
 
475 aa  415  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.5 
 
 
477 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.89 
 
 
478 aa  359  8e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  40.8 
 
 
458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.75 
 
 
474 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.19 
 
 
475 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.74 
 
 
465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.98 
 
 
477 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  38.24 
 
 
462 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.23 
 
 
461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.33 
 
 
456 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 
477 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.83 
 
 
483 aa  257  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.54 
 
 
482 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.41 
 
 
483 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.54 
 
 
500 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  34 
 
 
416 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  35.98 
 
 
470 aa  229  7e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.06 
 
 
486 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 
501 aa  225  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 
478 aa  225  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.13 
 
 
472 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 
496 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 
522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  33.33 
 
 
457 aa  221  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  33.09 
 
 
457 aa  220  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.17 
 
 
474 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
457 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  32.85 
 
 
457 aa  219  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  32.85 
 
 
457 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  32.85 
 
 
457 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  32.85 
 
 
457 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  32.61 
 
 
457 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  32.61 
 
 
457 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  33.25 
 
 
457 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  32.82 
 
 
462 aa  218  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.4 
 
 
482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  30.79 
 
 
488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.53 
 
 
502 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  28.26 
 
 
503 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  31.77 
 
 
455 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.76 
 
 
474 aa  209  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  32.12 
 
 
480 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 
522 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  31.51 
 
 
455 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  31.27 
 
 
455 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  31.27 
 
 
455 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  32.55 
 
 
464 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.14 
 
 
469 aa  206  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.37 
 
 
457 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.37 
 
 
457 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.37 
 
 
457 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.37 
 
 
457 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.37 
 
 
457 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.37 
 
 
457 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  31.02 
 
 
455 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  31.02 
 
 
455 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  30.71 
 
 
455 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.17 
 
 
495 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  30.71 
 
 
455 aa  205  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.84 
 
 
487 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  30.71 
 
 
455 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 
457 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.05 
 
 
579 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 
514 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  29.89 
 
 
467 aa  201  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  30.68 
 
 
473 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  32.59 
 
 
467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 
512 aa  201  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  30.69 
 
 
465 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  30.41 
 
 
475 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  29.57 
 
 
470 aa  199  7e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  31.37 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  30.59 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.98 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.85 
 
 
471 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  31.22 
 
 
476 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.23 
 
 
502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  30.69 
 
 
490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  31.99 
 
 
466 aa  196  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  27.49 
 
 
510 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  30.26 
 
 
465 aa  196  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  34.65 
 
 
456 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  37.02 
 
 
456 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  31.54 
 
 
492 aa  194  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.44 
 
 
455 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.69 
 
 
488 aa  193  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
545 aa  193  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.16 
 
 
497 aa  193  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 
516 aa  193  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
455 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.48 
 
 
534 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
464 aa  192  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  32.88 
 
 
596 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
459 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>