More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2482 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
493 aa  970    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.49 
 
 
475 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.41 
 
 
478 aa  431  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.35 
 
 
477 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.76 
 
 
482 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.55 
 
 
482 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  41.46 
 
 
458 aa  331  2e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.82 
 
 
474 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.97 
 
 
475 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.96 
 
 
477 aa  279  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.02 
 
 
477 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.25 
 
 
456 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.12 
 
 
483 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.85 
 
 
465 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.76 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.43 
 
 
461 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.51 
 
 
500 aa  246  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.05 
 
 
483 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 
482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.87 
 
 
501 aa  232  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  32.38 
 
 
457 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.82 
 
 
486 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
445 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.95 
 
 
478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  34.65 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 
457 aa  221  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  34.41 
 
 
457 aa  221  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  34.41 
 
 
457 aa  221  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  34.41 
 
 
457 aa  221  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  34.41 
 
 
457 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  34.16 
 
 
457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  34.16 
 
 
457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  34.41 
 
 
457 aa  220  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  33.12 
 
 
462 aa  218  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 
459 aa  216  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  30.49 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  30.49 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  30.49 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 
472 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.47 
 
 
471 aa  212  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 
457 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.3 
 
 
457 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 
457 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 
457 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 
457 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 
457 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 
496 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  34.43 
 
 
459 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  30.56 
 
 
455 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  30.56 
 
 
455 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  33.33 
 
 
480 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  33.81 
 
 
470 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  34.18 
 
 
442 aa  209  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 
478 aa  208  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.71 
 
 
474 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  31.29 
 
 
488 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  30.56 
 
 
455 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 
457 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
459 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  30.3 
 
 
455 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  30.3 
 
 
455 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.56 
 
 
482 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  31.49 
 
 
475 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  31.23 
 
 
457 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 
579 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 
487 aa  203  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
514 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  32.67 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  30.53 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.85 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  30.28 
 
 
455 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  31.55 
 
 
490 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  33 
 
 
459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  31.71 
 
 
498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  33.84 
 
 
416 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 
495 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
455 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  30.36 
 
 
464 aa  196  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  29.13 
 
 
473 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.46 
 
 
512 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  30.09 
 
 
503 aa  194  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  29.08 
 
 
472 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.22 
 
 
509 aa  193  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  30.82 
 
 
484 aa  192  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  29.13 
 
 
446 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  30.66 
 
 
470 aa  192  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  29.12 
 
 
453 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  30.92 
 
 
491 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  29.12 
 
 
453 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 
491 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  32.51 
 
 
476 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.27 
 
 
489 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  28.42 
 
 
510 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.93 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  29.58 
 
 
469 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  28.66 
 
 
492 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 
520 aa  189  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 
522 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>