More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1124 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 489 aa  915    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.84 
 
 		 488 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  62.74 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52 
 
 		 510 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.25 
 
 		 468 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.87 
 
 		 486 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  45.71 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.04 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.7 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1215  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.03 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.57 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.08 
 
 		 474 aa  329  9e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.87 
 
 		 522 aa  303  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.34 
 
 		 489 aa  266  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.72 
 
 		 478 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.65 
 
 		 528 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.3 
 
 		 527 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.57 
 
 		 763 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.05 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.75 
 
 		 646 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.75 
 
 		 646 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.5 
 
 		 646 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.49 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.35 
 
 		 469 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.63 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.75 
 
 		 469 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.54 
 
 		 478 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.41 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.54 
 
 		 524 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 520 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.01 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.01 
 
 		 512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.68 
 
 		 520 aa  235  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.81 
 
 		 478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.09 
 
 		 478 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.09 
 
 		 484 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.17 
 
 		 511 aa  233  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.84 
 
 		 478 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.2 
 
 		 487 aa  233  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  38.04 
 
 		 470 aa  232  9e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.38 
 
 		 540 aa  232  9e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  35.86 
 
 		 579 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.23 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.31 
 
 		 522 aa  230  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  35.01 
 
 		 530 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.16 
 
 		 609 aa  230  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  38.22 
 
 		 492 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 		 521 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 534 aa  229  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.97 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.88 
 
 		 520 aa  227  4e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.08 
 
 		 522 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 627 aa  227  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.95 
 
 		 520 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.76 
 
 		 534 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.01 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 463 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.82 
 
 		 485 aa  223  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 519 aa  223  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.71 
 
 		 487 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.25 
 
 		 518 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 528 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 		 486 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 		 486 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.23 
 
 		 492 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 		 486 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 		 514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.04 
 
 		 529 aa  220  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.19 
 
 		 525 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.32 
 
 		 505 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.56 
 
 		 476 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 509 aa  217  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  37.16 
 
 		 511 aa  216  8e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.19 
 
 		 579 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.06 
 
 		 626 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.86 
 
 		 538 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.96 
 
 		 503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.47 
 
 		 539 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.33 
 
 		 500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 		 531 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.47 
 
 		 557 aa  213  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
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NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  37.97 
 
 		 1065 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
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NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.62 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
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NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 508 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 		 508 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
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NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.37 
 
 		 529 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.4 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 397 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.89 
 
 		 583 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.28 
 
 		 532 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
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