More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0007 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 531 aa  1038    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.59 
 
 		 520 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.29 
 
 		 522 aa  303  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.08 
 
 		 534 aa  289  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 607 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 		 520 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.64 
 
 		 532 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.46 
 
 		 522 aa  273  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 519 aa  269  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.07 
 
 		 519 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.4 
 
 		 538 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 509 aa  264  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 507 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 		 503 aa  263  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.13 
 
 		 525 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  37.45 
 
 		 502 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.92 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 533 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 		 534 aa  250  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.1 
 
 		 502 aa  250  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 511 aa  249  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.38 
 
 		 485 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 525 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  35.21 
 
 		 525 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 525 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.41 
 
 		 626 aa  247  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.74 
 
 		 488 aa  246  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.68 
 
 		 503 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 508 aa  243  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.43 
 
 		 524 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 517 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.24 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.03 
 
 		 498 aa  237  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.85 
 
 		 458 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 523 aa  236  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 555 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  34.35 
 
 		 500 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 513 aa  233  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 		 489 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.93 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.52 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 503 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.2 
 
 		 478 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.2 
 
 		 484 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.2 
 
 		 478 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  37.13 
 
 		 535 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.7 
 
 		 478 aa  228  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  32.85 
 
 		 530 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.1 
 
 		 480 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.49 
 
 		 508 aa  226  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.66 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.51 
 
 		 469 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.22 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.21 
 
 		 466 aa  224  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 474 aa  224  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 		 512 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.3 
 
 		 518 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 528 aa  219  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 521 aa  219  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.68 
 
 		 504 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 516 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 		 478 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 562 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.55 
 
 		 540 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.59 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.3 
 
 		 487 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 		 524 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.04 
 
 		 583 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 500 aa  217  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 520 aa  217  5e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.87 
 
 		 487 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 524 aa  216  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 517 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1034  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 536 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 478 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 526 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.66 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  33.27 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1007  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 536 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1024  major facilitator superfamily transporter  34.16 
 
 		 536 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.2 
 
 		 516 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.72 
 
 		 487 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.4 
 
 		 502 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 525 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>