More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3204 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 538 aa  1047    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.62 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  50.1 
 
 		 520 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.63 
 
 		 532 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  44.64 
 
 		 503 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.86 
 
 		 534 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.77 
 
 		 626 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.35 
 
 		 522 aa  343  5.999999999999999e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.87 
 
 		 525 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  37.45 
 
 		 518 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 533 aa  276  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  35.69 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.35 
 
 		 520 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 516 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 528 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  38.88 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 		 555 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 519 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 		 607 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 526 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  38.22 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 584 aa  249  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 511 aa  249  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 509 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.33 
 
 		 502 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 525 aa  246  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  34.97 
 
 		 525 aa  246  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 525 aa  246  9e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 528 aa  246  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 517 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 		 522 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 		 529 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  37.45 
 
 		 521 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 558 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  38.24 
 
 		 554 aa  239  6.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 524 aa  239  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 588 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 517 aa  237  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.61 
 
 		 488 aa  236  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 508 aa  236  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 541 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 507 aa  233  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 510 aa  230  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 486 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 532 aa  230  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 486 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 486 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 486 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 486 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 486 aa  229  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.62 
 
 		 458 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.23 
 
 		 528 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.04 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.65 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  33.27 
 
 		 519 aa  226  8e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.78 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.78 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 523 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 536 aa  224  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  37.34 
 
 		 505 aa  224  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  33.27 
 
 		 553 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.28 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.23 
 
 		 537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  33.99 
 
 		 508 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 601 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 575 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  36.2 
 
 		 517 aa  220  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 514 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 		 513 aa  219  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 540 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.1 
 
 		 489 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.71 
 
 		 466 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 525 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  33.9 
 
 		 492 aa  216  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 500 aa  216  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 513 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 509 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.53 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 503 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.95 
 
 		 512 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 539 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 496 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.94 
 
 		 646 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.94 
 
 		 646 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.72 
 
 		 646 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.17 
 
 		 478 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  34.55 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 509 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 		 532 aa  210  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>