More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3406 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 528 aa  986    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  68.73 
 
 		 554 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  59.84 
 
 		 509 aa  532  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  54.65 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  58.99 
 
 		 505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  60.84 
 
 		 524 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  55 
 
 		 588 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  49.03 
 
 		 519 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  55.29 
 
 		 517 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  59.63 
 
 		 536 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  47.42 
 
 		 532 aa  425  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  48.19 
 
 		 524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  56.22 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  48.9 
 
 		 528 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  50 
 
 		 533 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  51.64 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 		 529 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  51.64 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  51.64 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 		 562 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 526 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  49.4 
 
 		 521 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  49.9 
 
 		 575 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 		 518 aa  364  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.48 
 
 		 537 aa  363  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  48.1 
 
 		 601 aa  363  5.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  46.87 
 
 		 584 aa  362  6e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 513 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  48.41 
 
 		 509 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  48.74 
 
 		 558 aa  360  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  46.86 
 
 		 555 aa  359  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 		 541 aa  359  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  48.45 
 
 		 521 aa  351  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  46.38 
 
 		 509 aa  350  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  48.67 
 
 		 508 aa  348  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  48.66 
 
 		 563 aa  347  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  50.2 
 
 		 535 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 536 aa  345  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  48.69 
 
 		 539 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  47.54 
 
 		 516 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  43.76 
 
 		 553 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  52.6 
 
 		 524 aa  337  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 540 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  45.7 
 
 		 508 aa  335  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  44.4 
 
 		 535 aa  334  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 481 aa  333  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  48.88 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 509 aa  329  6e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  49.79 
 
 		 502 aa  327  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  43.84 
 
 		 517 aa  323  6e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  44.23 
 
 		 516 aa  319  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  43.96 
 
 		 503 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 528 aa  311  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 		 506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  45.44 
 
 		 477 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 490 aa  306  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  45.7 
 
 		 514 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  45.44 
 
 		 497 aa  302  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 511 aa  299  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  46.07 
 
 		 513 aa  299  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  43.3 
 
 		 517 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  41.86 
 
 		 495 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  41.86 
 
 		 495 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  41.86 
 
 		 495 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  41.86 
 
 		 495 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  45.67 
 
 		 528 aa  286  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  41.65 
 
 		 495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 503 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.95 
 
 		 525 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.03 
 
 		 534 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 500 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  40.17 
 
 		 500 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  39.84 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  40.09 
 
 		 513 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 520 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 		 507 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 		 516 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 495 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  38.49 
 
 		 494 aa  253  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.58 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  41.36 
 
 		 516 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.92 
 
 		 607 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 519 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  38.28 
 
 		 500 aa  250  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  41 
 
 		 514 aa  250  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 504 aa  250  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.98 
 
 		 520 aa  244  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.55 
 
 		 519 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.09 
 
 		 522 aa  243  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 		 503 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.97 
 
 		 503 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  40.77 
 
 		 501 aa  239  6.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  41.99 
 
 		 501 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.54 
 
 		 532 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 594 aa  233  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.97 
 
 		 531 aa  230  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>